|
|
|
GCUGGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCAGCGCUGGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCAGC |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((((.......))))).))))....((((..((.((.((((.(((....)))((((.(((((.......))))).))))....))))..)).)).)))).))))) |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).))))) |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).(((....)))((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).))))) |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((((.......))))).))))....(((..........)))..((....)).((((.(((((.......))))).)))).....................))))) |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((((.......))))).))))....((((.((((.((((........))))(((((.(((((.......))))).)))))......)))).....)))).))))) |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).((((()))))((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).))))) |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.....(((((.......))))).........((((........)))).)))))(((((.....(((((.......))))).........((((........)))).))))) |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).))))) |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).))))) |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).))))) |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).))))) |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).))))) |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.....(((((.......))))).........((((........)))).)))))(((((.....(((((.......))))).........((((........)))).))))) |
|
NanoFolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.((((bbbbbb(...aaaaaa([[.[[[[[(...<<<<<(..{{{{..)))))(((((.)}}})}>>>)>((.>]]]]]])).)]AAAAAA.)BBBBB..B)))..))))) |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).))))) |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((((.......))))).))))....(((((.....).)))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....(((((.....).)))).))))) |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.....(((((.......))))).........((((........)))).)))))(((((.....(((((.......))))).........((((........)))).))))) |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).))))) |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).))))).((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))). |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).))))) |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..((((.......))))..))).....((((.(((.((((((((((((..)))))(((..((((.......))))..))).....))))).)).))))))))))))) |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.(((.(((((.......))))).))).....(((..........))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).))))) |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).))))) |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.(((.(((((.......)))))..(((.....))).(((..((((........))))..))).(((((.......))))).))).....((((........)))).))))) |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.(((..((((.......))))..))).....((((........)))).))))).((((.(((..((((.......))))..))).....((((........)))).)))). |