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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00573



RNA: PDB_00573
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((((.......))))).))))....((((..((.((.((((.(((....)))((((.(((((.......))))).))))....))))..)).)).)))).)))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).(((....)))((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))
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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((((.......))))).))))....((((.((((.((((........))))(((((.(((((.......))))).)))))......)))).....)))).)))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).((((()))))((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.....(((((.......))))).........((((........)))).)))))(((((.....(((((.......))))).........((((........)))).)))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.....(((((.......))))).........((((........)))).)))))(((((.....(((((.......))))).........((((........)))).)))))
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((bbbbbb(...aaaaaa([[.[[[[[(...<<<<<(..{{{{..)))))(((((.)}}})}>>>)>((.>]]]]]])).)]AAAAAA.)BBBBB..B)))..)))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((((.......))))).))))....(((((.....).)))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....(((((.....).)))).)))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.....(((((.......))))).........((((........)))).)))))(((((.....(((((.......))))).........((((........)))).)))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).))))).((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))).
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..((((.......))))..))).....((((.(((.((((((((((((..)))))(((..((((.......))))..))).....))))).)).)))))))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((.(((((.......))))).))).....(((..........))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((.(((((.......)))))..(((.....))).(((..((((........))))..))).(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((..((((.......))))..))).....((((........)))).))))).((((.(((..((((.......))))..))).....((((........)))).)))).