|
|
|
GGCCCCAUCGUCUAGCGGUUAGGACGCGGCCCUCUCAAGGCCGAAACGGGGGUUCGAUUCCCCCUGGGGUCACCAGGCCCCAUCGUCUAGCGGUUAGGACGCGGCCCUCUCAAGGCCGAAACGGGGGUUCGAUUCCCCCUGGGGUCACCAAA |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))......
|
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((..(((((........)))))(((((.......)))))....(((((.(((...(((((.((((((....))))))..(((((........)))))(((((.......)))))....)))))..)))..))))).))))))...... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.(((((........)))))(((((.......)))))....(((((.((((..((((((((((((....))))))).(((((........)))))(((((.......)))))....))))).))))..))))))))))))...... |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.(((((........)))))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))................................................................................. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))...... |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.(((((........)))))(((((.......)))))....(((((.((((..((((((((((((....))))))).(((((........)))))(((((.......)))))....))))).))))..))))))))))))...... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((.(((((.((((((((.......)))))....(((((.......)))))(((((((....))))))).)))))))).))).)))))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))...... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((.(((((.((((((((.......)))))....(((((......))))).(((((((....))))))).)))))))).)))).))))(((((.......)))))....(((((......))))).)))))))...... |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((.(((((.((((((((.......)))))....(((((......))))).(((((((....))))))).)))))))).)))).))))(((((.......)))))....(((((......))))).)))))))...... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((.(((((.((((((((.......)))))....(((((.......)))))(((((((....))))))).)))))))).))))).)))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))...... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((.((((.(((((((((.......)))))....(((((......))))).(((((((....))))))).)))))))).)))).))))(((((.......)))))....(((((......))))).)))))))...... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.(((((........)))))(((((.......)))))....(((((.((((..((((((((((((....))))))).(((((........)))))(((((.......)))))....))))).))))..))))))))))))...... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((..((((((((.((((.(((((((((.......)))))....(((((.......))))).((((((....))))))..)))))))).))))).)))(((((.......)))))....(((((.......))))).))))))...... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((.((((.(((((((((.(....))))))....(((((.[[[[.))))).(((((((....))))))).)))))))).)))).))))(((((.(....))))))....(((((.]]]].))))).)))))))...... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...((((((.....((((((((((.......)))))....(((((......))))).(((((((....))))))).)))))....))))))...(((((.......)))))....(((((......))))).)))))))...... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((..((((((((.(((((.((((((((.......)))))....(((((.......))))).((((((....))))))..)))))))).)))).))))(((((.......)))))....(((((.......))))).))))))...... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..(((((((.(((((.((((((((.......)))))....(((((.......))))).((((((....))))))..)))))))).))).)))).(((((.......)))))....(((((......))))).)))))...))... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((.((((.(((((((((.......)))))....(((((.......)))))(((((((....))))))).)))))))).))))).)))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))...... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..))..((((((......))))))(((.((((..)))))))....((((((...)..)))))(((((((....))))))).((((((......))))))(((.((((..))))))).((.((((((...)..))))).))((...))... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((.((((.(((((((((.......)))))....(((((......))))).(((((((....))))))).)))))))).)))).))))(((((.......)))))....(((((......))))).)))))))...... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((.(((((.((((((((.......)))))....(((((......))))).(((((((....))))))).)))))))).)))).))))(((((.......)))))....(((((......))))).)))))))...... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((...((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))).((((((....))))))...((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))).))))))...... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.....))))..(((..(((((.......)))))....(((((.[[[[..))))).((((((....)))))).(((]]]..)))........(((((.......)))))....{{{{{.])))..}}}}}.))))))...... |