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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00593



RNA: PDB_00593
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((........))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))......
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((((........)))))(((((.......)))))....(((((.(((...(((((.((((((....))))))..(((((........)))))(((((.......)))))....)))))..)))..))))).))))))......
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........)))))(((((.......)))))....(((((.((((..((((((((((((....))))))).(((((........)))))(((((.......)))))....))))).))))..))))))))))))......
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........)))))(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).................................................................................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))......
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........)))))(((((.......)))))....(((((.((((..((((((((((((....))))))).(((((........)))))(((((.......)))))....))))).))))..))))))))))))......
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((.(((((.((((((((.......)))))....(((((.......)))))(((((((....))))))).)))))))).))).)))))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))......
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((.(((((.((((((((.......)))))....(((((......))))).(((((((....))))))).)))))))).)))).))))(((((.......)))))....(((((......))))).)))))))......
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((.(((((.((((((((.......)))))....(((((......))))).(((((((....))))))).)))))))).)))).))))(((((.......)))))....(((((......))))).)))))))......
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((.(((((.((((((((.......)))))....(((((.......)))))(((((((....))))))).)))))))).))))).)))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))......
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((.((((.(((((((((.......)))))....(((((......))))).(((((((....))))))).)))))))).)))).))))(((((.......)))))....(((((......))))).)))))))......
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........)))))(((((.......)))))....(((((.((((..((((((((((((....))))))).(((((........)))))(((((.......)))))....))))).))))..))))))))))))......
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((((((.((((.(((((((((.......)))))....(((((.......))))).((((((....))))))..)))))))).))))).)))(((((.......)))))....(((((.......))))).))))))......
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((.((((.(((((((((.(....))))))....(((((.[[[[.))))).(((((((....))))))).)))))))).)))).))))(((((.(....))))))....(((((.]]]].))))).)))))))......
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...((((((.....((((((((((.......)))))....(((((......))))).(((((((....))))))).)))))....))))))...(((((.......)))))....(((((......))))).)))))))......
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((((((.(((((.((((((((.......)))))....(((((.......))))).((((((....))))))..)))))))).)))).))))(((((.......)))))....(((((.......))))).))))))......
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((.((((.(((((((((.......)))))....(((((.......)))))(((((((....))))))).)))))))).))))).)))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))......
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((..))..((((((......))))))(((.((((..)))))))....((((((...)..)))))(((((((....))))))).((((((......))))))(((.((((..))))))).((.((((((...)..))))).))((...))...
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((.((((.(((((((((.......)))))....(((((......))))).(((((((....))))))).)))))))).)))).))))(((((.......)))))....(((((......))))).)))))))......
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((.(((((.((((((((.......)))))....(((((......))))).(((((((....))))))).)))))))).)))).))))(((((.......)))))....(((((......))))).)))))))......
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))).((((((....))))))...((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))).))))))......
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.....))))..(((..(((((.......)))))....(((((.[[[[..))))).((((((....)))))).(((]]]..)))........(((((.......)))))....{{{{{.])))..}}}}}.))))))......