RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00609

RNA: PDB_00609
Rfam family: -

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RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.((..((.((((((.(((.....))).)).)))).))......(((((((.......(((((.(((((.(((((((..(((.....))).(((((((((.((((((..((((....))))((((....)))).((((....))))(((...(((((..(((((......))))).))))).((((..(((......)))..)))).......((.....))...))).((((.((((....((((((.(((..(((...((((((....))))))..((((.....)))).........)))....))).))))))......((((((((((.....))))))))))...(((((((((((((((((((.(((((...(((((((.....(((.............((....))....(((.......))).)))...)))))))........((((....((((.........(((((((.(.((((((.(((.(((((((((((((((...(((((..((((..((...((((.((((((((((..((((..(((....)))..))))...((....))..((((.....)))).......))))))))))))))........((((((...(((((((..((((..((((..(((((......)))))((((((((((...)))).))).)))........)))).)).))..))))))).(((.....)))......)))))).....))..))))..(((((.((((.((((((((..(((((((((...((((.((((((...(((...(((.((((......)))).)))..)))....)))))).).)))..))))).(((((.(((((((..((....))..)))))))....(((......)))..(((((((((....((((((...(.(((((((.........((.(((((((((((...(((.....(((((.(((((.......))))).)))))....((((.((....)).)))).)))..)))))))))))))....((((((((.((((......((((((........(((..((((((((...))))))))))))))))).)))).(((((((.((......(((((.((....)).)))))...)).)))))))....(..(..((((..............((((((.......))))))((((((...(((.....((((((((...((.....)).))))))))..))).((.(((......)))))..))))))..))))..)..).(((((........))))).))))))))...))))))).))))))).................((((.....))))...))))).)))).)))))..))))((((((...((.....)).))))))...)))))))))))).))))).)))))((((((.((...(((((....(((((((.((..((((....))))...(((......)))...))))))..)))...)))))....)).)))))).............))))))))..(((..((((((((.((.....((((......(((((.....(((....))))))))((((((((...)))))))).))))...(((((((((((((...................((((((((....(((.....)))......)))))))).(((((((((((.((((....)).))..))).)).(((((.(((((...........(((.....))).((((((.......)))))).....)))))..........((((((.....)))))).)))))...))))))..)).))))))).)))))).)))))))).)))..............(((((((....)))))))....))))))).(((.......((((((.(((((..(((...(((.(((((.(..(((((((((((((......(((((.....(((((....)))))..)))))..)))))))))))))..)...(((((((......)))))))....))))).))).)))))))).)).)))).((.(((((((...........))))))).))....)))..(((.(((((((.....)))))))...))).......))).)))))).).)))))))........)))).....))))(((....))).))))).)))...))))))).))))))))).))))....))))..))))))...((((((....)).))))..((..(((((((((((.........)))..))))))).)..)).)))))).))).)))))))..(((((((((((......)))))).))))).))))).)))))........(((((((((...((((.(((.(((((((....))).)))).((((....((...((((.....((((((((.(((((..(..((((..((.(....).)).))))..).(((((...((((..((((((((((((....))))))...))))))..)))).)))))....((....(((((...........)))))....))..))))....).))))))))..))))...))..)))).(((((.......)))))....))).)))))))))).))).......))))))).)).(((((((....)))))))...))))))))).(((((((((((...((.(((((....(((.....((((........))))..)))...)))))..))..........((.(((((....))))).)).......))...)))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.....((.((((..................)))).))......(((((((.......(((((.((((((((((((((((..............................(((....))).((((....)))).((((....))))......(((((..(((((......))))).))))).....................................................((((....((((((.(((..(((...((((((....))))))........................)))....))).))))))......((((((((((.....))))))))))...(((((((((((((((((((.(((((.....(((((....(((.......((((((.((....))....(((........((((....)))).......(((.....((................((((((((((((((....).)))))))))).)))................(((((...(((.((((((((((..((((..(((....)))..))))...((....))..((((.....)))).......))))))))))))).((((((..(((.((((((((.(((.(((..(((..(..(((((......))))).(((((((....((((...(((......)))..))))...((((((.((((((..((..........))..)))))).)))))).)))))))((((..(((((....)))))...))))...)..)))..))).)))...((((((....(((......................(((((.........(((.(((.....(((((((..((....))..))))))).....(....)..))).)))...........)))))...........................................))).(((((.(((((.......))))).)))))...))))))....))))))))))))))))).......))))).......))....))).........)))...))))))....((((((((...))))))))...)))..)))))((((((((((((((..(((((((.((....))((.(((((.((((((((..((.(.(((((((((...((((.......((((((.......))))))..((....)).....(((((((((((.....((((((.......................((....(((((.((((..((((........(((((........)))))......................................................))))..)))).)))))........((((...(..((.((.....)))).)....((((..(((.((((...((((((((.((.((.(.((..(..(....).)..)).).)).))..))))))))..)))))))..))))...))))...))..............(((((..((((......))))..))))).........((((((((.........(((......(((((.....(((....))))))))((((((((...)))))))).))).....((((((((((((....................((((((((...(((.....)))...))..))))))...((((((((((.((((....)).))..))).)).(((((.(((((...........(((.....))).((((((.......)))))).....)))))..........((((((.....)))))).)))))...)))))...)).))))))).)))....))))))))..................((((((......))))))...........)))))).....))))).)))))).))))...).)))))))).).)).(.((((((((.((....))..)))))))).).))))))))..))))))).............((((..(((((((......)))))))....((((((..(........(((((...(.((.(((((((...........))))))))))...))))).....(((((((.....))))))))..))))))......)))).)))))))..))))).)))))).))).........(((....))).))))).)))...))))))).))))))))).))))...................((((((....)).))))..((...((((.......................))))....)).........))))))))))).(((((((((((......)))))).))))).))))).)))))........(((((((((...((((.(((.(((((((....))).))))(((((..(.((...((((.....((((((((.(((((..(..((((..((.(....).)).))))..).(((((...((((..((((((((((((....))))))...))))))..)))).)))))....((....(((((...........)))))....))..))))....).))))))))..))))...))).)))))(((((.......)))))....))).)))))))))).))).......)))))))....(((((((....)))))))...))))))))).(((((((((........(((((....................................)))))..............((.(((((....))))).))............)))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	................((((.....)))).((((.((((((..((((((......((.(((..((((((.....((((((.((((.(......)))))....))))))..((((((..(((....))).((((....)))).((((....))))(((...(((((..(((((......))))).)))))................((((...((((.....))))....)))))))..((((........((((((.(((..(((...((((((....))))))..((((.....)))).........)))....))).))))))......((.(((((((.(((..((((((.((((((((((((((....))))))..((((...........(((((.....(((((((...((....))...(((((.......((((....))))...................(((((.(((.......))))))))))))))))))))))))).(((((((.......(((((((((((((..((((.((((((((((..((((..(((....)))..))))...((....))..((((.....)))).......))))))))))))))........((((..((((((.((((..(((((((....(((((......)))))(((.((((((...)))).)).(((....((.(((..(((.......)))..))).))...)))...))))))))))..)).))))))))..(((((.((((.((((((((..(((((((((...(((..((((((...(((...(((.((((......)))).)))..)))....))))))...)))..))))).(((((.(((((((..((....))..)))))))....(((......)))..(((((((((...((((((....(((((((...))))))).((.((..(((((((...(((.....(((((.(((((.......))))).)))))....((((.((....)).)))).)))..)))))))..))))..........))))))...............((((((((...((((((((...))))))))..(((((..(((((((((((((.((......((((..((....))..))))...)).)))))).(((((.....((((..............((((((.......))))))((((((...(((.....((((((((...(((...))).))))))))..))).((.(((......)))))..))))))..)))).......(((((........))))).((.(((((.....))))))).....))))).))))..)))..)))))..))))))))..))))).)))).)))))..))))((((((.............))))))...)))))))))))).))))).(((((....)))))....)))).....(((.((((((((....((((..((..((((((....((((.((((...(((((.((((.(((.((.(((....((((..(((..(((..(((.((((....((((((((.((.....((((......(((((.....(((....))))))))((((((((...)))))))).))))...(((((((((((((...................((((((((....(((.....)))......)))))))).(((((((((((.((((....)).))..))).)).(((((.(((((...........(((.....))).((((((.......)))))).....)))))..........((((((.....)))))).)))))...))))))..)).))))))).)))))).)))))))).)))))))...)))....(((((((....)))))))........))).))))....))))).)))....(((((((.((((((.....(..((((..(((((((......(((((.....(((((....)))))..)))))..)))))))..))))..)...(((((((......)))))))..((.(((((((((..((((((.....((((....((((((...........))))))))))..(((((((((..((((((((...)))))))).....((......))...))))))))).......))))))...))))))))).)).(....).))))))))))))).))))(....).)))))..)))).)))).))))))..))...((((((....)).)))).)))).(((((((((((.........)))..))))))))))))))))))).))))))))))).)).((((((((((......)))))).)))).(((((.....))))).......))))))).))))))))))))..))))))((..(((((((((........((((.((((((.((.((((....(((((..((((...........((.(((.......))).))(((((..((((.((((((((....)))))..((((....((((..((((((...))))))...))))...))))...)))))))..)))))........)))).)))))...)))).((((((((((((((.......)))))....((((((((.(((..((((((....))))))...)))..))))).))).........)))))).)))...)).)))))).))))...((((.......)))).....)))))))))..))......))))))))))))..))))..))))))))))))))).)).....)))))))))))))))).

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