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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00629



RNA: PDB_00629
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] ((((((..((((((..)))))).))))))((((((..(((((....))))).))))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((((....((((...(((....)))....))))....))))...)))))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((((.((.((((...(((....)))....)))).)).))))...)))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((((....((((...(((....)))....))))....))))...)))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((((....))))...(((....)))....((((....))))...)))))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((.....((......))....(((....)))......(......).....)))).
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((((....))))...))))).((((....((((....))))...)))).
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((((....))))...((((()))))....((((....))))...)))))
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] .........((((....))))..(((((((.(((....[[[[))).]]]].)))))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((........)))((((...[[[[[[[..))))..((((....)))).]]]]]]]
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((..((((......))))..)).(((((((..((((.........))))..)))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((..((((......))))..)).(((((((...((((......))))....)))))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((((....))))...)))))(((((....((((....))))...)))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((..((((......))))..)).(((((((..((((.........))))..)))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((...................)))))(((((...................)))))
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((...((((....))))))(((((((..((((.........))))..)))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((..((((......))))..)).(((((((...((((......))))....)))))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((......)))).....(((((((..(((((......).))))..)))))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................(((((((..((((.........))))..)))))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] .........((((....))))..(((((((...((((......))))....)))))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((..((((......))))..)).(((((((...((((......))))....)))))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((..((((......))))..)).(((((((...((((......))))....)))))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((..((((......))))..)).(((((((...((((......))))....)))))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((((...).)))...)))))(((((....((((...).)))...)))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................(((((((.....................)))))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((..((((......))))..)).(((((((...((((......))))....)))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .........((((....))))....(((((..((((.........))))..)))))..
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .........((((....))))...((((((..((((.........))))..)))))).