RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00648

RNA: PDB_00648
Rfam family: -

			AGCACGGCUUAAACCGUGCAGCACGGCUUAAACCGUGCUUUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((......)))))))((((((......))))))....
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((......))))).(((((((......))))))).))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.((((.(((((...))))).)))).)))))))...
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......)))))).((((((......))))))....
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.((((.(((((...))))).)))).)))))))...
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.((((.(((((...))))).)))).)))))))...
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......))))))(((((((......)))))))...
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.((((.((((((.)))))).)))).)))))))...
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......))))))(((((((......)))))))...
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......))))))(((((((......)))))))...
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......)))))).((((((......))))))....
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......)))))).((((((......))))))....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((([[[[.[[[[.[[[[)).((]]]].]]]].]]]])))...
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((...))))))))))))))))))...
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......)))))).((((((......))))))....
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......))))))(((((((......)))))))...
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......))))))(((((((......)))))))...
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......)))))).((((((......))))))....
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.[[[[.))))))(((((((.]]]].)))))))...
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......))))))(((((((......)))))))...
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.((((.(((((...))))).)))).)))))))...
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......)))))).((((((......))))))....
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......)))))).((((((......))))))....
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......))))))(((((((......)))))))...
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((...).))))))((((((((...).)))))))...
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......)))))).((((((......))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......)))))).((((((......))))))....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......)))))).((((((......))))))....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......)))))).((((((......))))))....

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