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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00663
RNA: PDB_00663
Rfam family:
-
| GGGGGGGGGGGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGGGGGGGGGGG | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | ...(((.((....)).)))......(((..((..))..)))... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((...))))))))(((((((((((...))))))))))) |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....)))))))(((((((((((....))))))))))) |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((....)))))))))(((((((((....))))))))) |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((....)))))))))(((((((((....))))))))) |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.....))))))))(((((((((....))))))))). |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((()))))))))))((((((((((())))))))))) |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((....))))))))))((((((((....)))))))) |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((...)))))))))((((((((((...)))))))))) |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((....))))))))))((((((((....)))))))) |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ............................................ |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((..)))))))))))(((((((((..))))))))) |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((...)))))))))((((((((((...)))))))))) |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((..)))))))))(((((((((((..))))))))))) |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((....))))))))))((((((((....)))))))) |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.[[[[[[[[[)))))))))))..]]]]]]]]]. |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((((.....))))))))((((((((.....)))))))). |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((........))))))))))).............. |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....))))))))((((((((((....)))))))))) |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((....))))))))))((((((((....)))))))) |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((....)))))))))).(((((((....))))))). |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....))))))))((((((((((....)))))))))) |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((..)))))))))))(((((((((..))))))))) |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ............................................ |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....))))))))((((((((((....)))))))))) |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((.....))))))).((((((((.....)))))))).. |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....)))))))).(((((((((....))))))))). |