CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
Home

Methods
Datasets
Rankings
RNA 2D Atlas

Help
FAQ

Contact us
RSS feeds
Twitter

RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00709



RNA: PDB_00709
Rfam family: -

GGCGAGCCGGCGAGCCGGCGAGCCGGCGAGCCGGCGAGCC
Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((())))))))(((((((())))))))........
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..((((((..))))))..))))))..)))
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..[[[[[[..))))))..]]]]]]..)))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..))))))..((((((..))))))..)))
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ........(((..((((((..........))))))..)))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((..(((((....)))))..)))))).....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((....)))))..(((((....))))).....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((..[[[[[[..))))))..]]]]]].....