|
|
|
GGGAGUGAAGGAGGCUCGCGAACUCGCGAAGCCGAGAAACUUCACUCCCGGGAGUGAAGGAGGCUCGCGAACUCGCGAAGCCGAGAAACUUCACUCCC |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((((....)))).)))))....))))))))))..(((((((((((((((((((....)))).)))))....)))))))))).
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..(((((((((..((((((.(((......((((((((....))))))))..)))))))))..))))).))))......)))))))))) |
|
Alterna
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....)))).))))......))))))))))((((((((((..((((((((....)))).))))......)))))))))) |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....))))).)))......))))))))))((((((((((..((((((((....))))).)))......)))))))))) |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..(((((((((..((((((.(((......((((((((....))))))))..)))))))))..)))))).)))......)))))))))) |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..(((((((((..((((((.(((......((((((((....))))))))..)))))))))..)))))).)))......)))))))))) |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((...((((((.(((......((((((((....))))))))..)))))))))...))))).)))......)))))))))) |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..(((((((((..((((((.(((......(((((((((())))))))))..)))))))))..)))))).)))......)))))))))) |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....))))).)))......))))))))))((((((((((..((((((((....))))).)))......)))))))))) |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....)))).))))......))))))))))((((((((((..((((((((....)))).))))......)))))))))) |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....)))).))))......))))))))))((((((((((..((((((((....)))).))))......)))))))))) |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....)))).))))......))))))))))((((((((((..((((((((....)))).))))......)))))))))) |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..(((((((((..(((((.((((......((((((((....))))))))..)))))))))..))))).))))......)))))))))) |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....)))).))))......))))))))))((((((((((..((((((((....)))).))))......)))))))))) |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..(((((((((..)))))).)))......))))))))))((((((((((..(((((((((..)))))).)))......)))))))))) |
|
Pknots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....)))).))))......))))))))))((((((((((..((((((((....)))).))))......)))))))))) |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....))))).)))......))))))))))((((((((((..((((((((....))))).)))......)))))))))) |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....)))).))))......))))))))))((((((((((..((((((((....)))).))))......)))))))))) |
|
RDfolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((..............))))...))))))))))((((((((((....((((..............))))...)))))))))) |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((.....((((((...((((...((((((((....))))))))....)))).....))))))...))))...)))))))))) |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....)))).))))......))))))))))((((((((((..((((((((....)))).))))......)))))))))) |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....)))).))))......)))))))))).(((((((((..((((((((....)))).))))......))))))))). |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....))))).)))......))))))))))((((((((((..((((((((....))))).)))......)))))))))) |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.(.(((((.(.((.(...))))))))).)))))))))))((((((((((.(.(((((.(.((.(...))))))))).))))))))))) |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..(((.((((....))))..)))......))))))))))((((((((((..(((.((((....))))..)))......)))))))))) |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....)))).))))......))))))))))((((((((((..((((((((....)))).))))......)))))))))) |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....)))).))))......((((((((....))))))))..((((((((....)))).))))......)))))))))) |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((....)))).))))......((((((((....))))))))..((((((((....)))).))))......)))))))))) |