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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00747



RNA: PDB_00747
Rfam family: -

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CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.((((......((......)).(((((((.....((((((...((...((((((....))))))..))...))))))(((.....((((((((..........))))))))...(((((..................)))))..)))..))))))))))))))))))......((..(((((....))))).....))..))))))...
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((..((....)).)))))))...((.......(((((((...((.(.((((((....)))))).)))...)))))))((...(.((((((((..........)))))))).)..))(((............)))))((((...(((....)))..))))...............(.(((((....))))).).......))))))...
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........((((((..((....)).))))))....((((((....((((((...((....((..........))...))...))))))(((...(.((......................)).)..))).............))))))((((...(((....)))..))))..................((((....))))...................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((.(((((((((..((....)).)))))))...((((((...(.((((....((...((((((....))))))..))....)))))(((.....((((((((..........))))))))....))).............))))))((((...(((....)))..)))).................(((((....)))))......)).)))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(.(((((((..((....)).)))))))(((((((((...(((((((...((.(.((((((....)))))).)))...)))))))((...(.((((((((..........)))))))).)..))....(........)))))))((((...(((....)))..))))........)))..(((.(((((....))))).)...))).))))))...
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((....((((((...........))))))((((.(((((....((((((....(((.((((((....)))))).)))...))))))(((..(((((((((((..........))))))))....))).(((...)))...)))...((((...(((....)))..))))..))))).)))).....(((((....))))).........))))))...
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.((.((((((..((....)).))))))((((.(((((...(((((((....(((.((((((....)))))).)))...))))))).((....((((((((..........))))))))))..(((((............)))))((((...(((....)))..))))..))))).)))).....(((((....)))))......)).))))))...
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((..((....)).)))))))....(((((....((((((...((...((((((....))))))..))...))))))(((.....((((((((..........))))))))....)))..........[[[))))).((((...(((....)))..))))........]]]......(((((....))))).........))))))...
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((((((..((....)).)))))))...((((((...(((((((....(((.((((((....)))))).)))...))))))).......((((((((..........))))))))....................))))))((((...(((....)))..))))..((......)).....(((((....)))))......)).))))))...
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...........)))))))..((((.......((((((........(((((((..))))))).......))))))(((.....((((((((..........))))))))...(((((..................)))))..)))....((((((.......)))))).......(((((....)))))....)))).))))))...
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((((((..((....)).)))))))..((((.((....((((((...((...((((((....))))))..))...))))))(((.....((((((((..........))))))))....)))...)).))))(((.((...((((...(((....)))..))))...))...)))......(((((....)))))......)).))))))...
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...........)))))))(((((((((...(((((((....(((.((((((....)))))).)))...))))))).......((((((((..........))))))))........(((...)))...))))))((((.(.(((....))).)))))........)))......(((((....))))).........))))))...
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...........)))))))...((((((...(((((((........((((((....)))))).......))))))).......((((((((..........))))))))....................))))))..............((((((.......)))))).......(((((....))))).........))))))...
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((((((..((....)).)))))))..((((.((....((((((...((...((((((....))))))..))...))))))(((...(.((((((((..........)))))))).)..)))...)).))))(((.((...((((...(((....)))..))))...))...)))......(((((....)))))......)).))))))...
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((...(((((((..((....)).)))))))..((((.((.....(((((...((...((((((....))))))..))...))))).(((.....((((((((..........))))))))....)))...)).)))).))))).((((((...(((....)))..))))..)).........(((.(((((....))))).....((....)))))..
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.((.((((((..((....)).))))))((((.(((((....((((((...((...((((((....))))))..))...))))))(((.....((((((((..........)))))))).....((.(((...))).)))))...((((...(((....)))..))))..))))).)))).....(((((....)))))......)).))))))...
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.((((..))))))))))..(((((((...(((((((((((((.(..((((((..))))))..))))))))))))))(..)....))).))))((((((((..........))))))))....((((((((...)))))))..).....((((((((..)).))))))..(....((((((..))))))...)).)))))))))...
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(..((((((..((....)).)))))).((...((((....((((((...((...((((((....))))))..))...))))))........((((((((..........))))))))..........................((((...(((....)))..))))..))))...))......(((((....))))).......).))))))...
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.((.((((((..((....)).))))))(((..(((((....((((((...((...((((((....))))))..))...))))))(((.....((((((((..........)))))))).....((.(((...))).)))))...((((...(((....)))..))))..)))))..))).....(((((....)))))......)).))))))...
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((..((....)).))))))).....((((......))))........((((((....)))))).((((........)))).(((((((((((..........))))))))....(((((............))))).(((((..((....)))).)))...)))............(((((....))))).........))))))...
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((..((....)).)))))))..((((.......((((((........((((((....)))))).<<<<..))))))>>>>.(((((((((((.....[[[[[))))))))....(((((............))))){{{....)))....((((((}}}....))))))....]]]]](((....)))......)))).))))))...