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| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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|
Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....)))))..(((....)))...((....((((..............(((.(((.((((....))))))).)))....(((...(((.(((.......))).)))(((((((((....))))))))).)))))))..)).)))) |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((((...))))))..(((((...(((.(((.....(((............(((((..(((((((....))))).)))))..)).......))).((((....)))).)))(((((((((....)))))))))...)))...)))))))) |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((.(((.((((....))))))).)))..)).......((.(((.......))).))((((((((((....))))))))).)..)))..)))))))) |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((((...)))))).((((....)))).........)))............(((((.((.((((((())))))))).)))..)).......((.(((((....(((....((((((((((....))))))))).)..)))..))))).)) |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((.....))))).((((....))))........((((............(((((....(((((.[[[)))))...]]]..{{{{.....)))))...............(((((((((....)))))))))....}}}}.)))).... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((...[[[[.))))....((((....))))........]]]]............((((.....(((((.[[[))))))))).....]]]....(((.[[[[[.........)))(((((((((....))))))))).........]]]]]... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...)))))).((((....))))..((....((((...........((((((.(((.((((....))))))).)))...)))....(((.(((.......))).)))(((((((((....)))))))))....))))...)))))) |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....))))).((((....))))..((....((((..............(((.(((.((((....))))))).)))....(((...(((.(((.......))).)))(((((((((....))))))))).)))))))..)).)))) |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...))))))..((([[..)))...........................(((.....((((....))))....)))...............................(((((((((....))))))))).........]]...... |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...))))))((((((..))))).)....(.((((.............(((((((((((..)))))))).))))))))(((((...(((.(((((....))))))))((((((((((..))))))))))........))))))))) |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...)))))).((((....))))..((....((((...........((((((.((.(((((....))))))).)))...)))....(((.(((.......))).)))(((((((((....)))))))))....))))...)))))) |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...)))))).((((....))))........((((............((((..))))(((((..)))))....)))).((((....(((..((((....)))).)))(((((((((....))))))))).........)))))))) |
|
Pknots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....))))).((((((..((((((.....))(((....................)))))))))))))((((((((............)).((((....)))).)).(((((((((....)))))))))))))((.....)))))) |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((.....)))))..[[[[[.))).........(((((...........((((((.((.(((((....))))))).)))...))).....((((((((....))))..)))).((((((....))))))..))))).....]]]]]... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((...)))))).((((....))))........((((...........((((((.((.(((((....))))))).)))...)))....(((.(((.(....)))).)))(((((((((....)))))))))....)))).....)))) |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...)))))).((((....))))........((((............((((.....(((((....))))))))).................((((....))))....(((((((((....)))))))))....))))......... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....))))).((((....))))..((....((((..............(((.(((.((((....))))))).)))....(((...(((.(((.......))).)))(((((((((....))))))))).)))))))..)).)))) |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.((((((...)))))).((((....))))..((......))...........)).(((.(((.((((....))))))).)))..((((....((((.((((....))))....(((((((((....))))))))))).))....)))).... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....)))))(((((....)))).)((....((((............(((((.((.(((((....))))))).)))..))(((...(((.(((.......))).)))(((((((((....))))))))).)))))))...)))))) |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.((((((...))))))))(((((..((((.(((..............)))...((((..)))).)))))))))((((.(((..(..((..))..).(((((..)).))).(((((((((((((..))))))).)))..)))....))))))) |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((...))))))..(((((................................(((.((.(((((....))))))).))).................(......)......(((((((((....))))))))).........)))))... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....))))).((((....))))..((....((((...........((((((.(((.((((....))))))).)))...)))....(((.(((.......))).)))(((((((((....)))))))))....))))..)).)))) |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((((.....))))).((((....)))).........(((............((((.....(((((....))))))))).....))).....(((((((.......)).))))).((((((....)))))).(((.........))).))) |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....))))).((((....)))).........................))))....(((((....))))).........((((....(((((((.......)).))))).((((((....)))))).(((.........))))))) |