|
|
|
GCCGGCCACACCUACGGGGCCUGGUUAGUACCUGGGAAACCUGGGAAUACCAGGUGCCGGCGCCGGCCACACCUACGGGGCCUGGUUAGUACCUGGGAAACCUGGGAAUACCAGGUGCCGGC |
Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
((((((....((....))(((((((((......((....)).....)))))))))))))))((((((....((....))(((((((((.((((((((..)))))))))))))))))))))))
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....(((((((.(((((((.....((.((....)).))....))))))).)))..((..((((..((....))...))))..))...))))..((((((.....)))))))))))) |
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..........)))).)))..((((((((....((((((....((((((((....(((((((..........)))).)))..))))))))....))))))....)))))))).... |
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((............(((((((.......................)))))))((((....))))............(((((((.....(((.(....)..)))...))))))))))))) |
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............................................................................(((((((.....((.((....)).))....)))))))...... |
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....)).(((((......((.((....)).)).....))))).)))))).(((((....((....)).(((((......((.((....)).)).....))))).))))). |
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))(((((((.....((((((...))))))...)))))))(((((())))))(..........)(((((((...(.((((((...)))))).).))))))))))))) |
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((............(((((((.....(((.........)))...)))))))))))))((((((............(((((((.....(((.........)))...))))))))))))) |
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((........(((.(((((((..((.((((((...)))))).))))))))).)))..))))))........(((.(((((((..((.((((((...)))))).))))))))).))).. |
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....)))))))))))))((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....))))))))))))) |
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....)))))))))))))((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....))))))))))))) |
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((........(((.(((((((.....((((((...))))))...))))))).)))..))))))........(((.(((((((.....((((((...))))))...))))))).))).. |
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((............(((((((.....((((((...))))))...)))))))))))))((((((............(((((((.....((((((...))))))...))))))))))))) |
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....)))))))))))))((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....))))))))))))) |
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((........(((.(((((((.....((((((...))))))...))))))).)))..))))))........(((.(((((((.....((((((...))))))...))))))).))).. |
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((((((((.((((.........((((..((((((.....))))))((((....))))....)))))))).)))).........))))..((((((.....)))))))))))) |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....)))))))))))))((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....))))))))))))) |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((....((....)).((((((.....((.((....)).))....)))))).))))).((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....))))))))))))) |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....)))))))))))))((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....))))))))))))) |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(.(((((..(((..)))...))))))((((((((((((((((((((.((((((..(..((.(.(((((..(((..)))...))))))))))))))).)))))))))))))))))))).... |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....)))))))))))))((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....))))))))))))) |
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....)))))))))))))((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....))))))))))))) |
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((((.((.............))))))...(((((.....))))).((((....))))....((((.((.............))))))...(((((.....))))).)))))) |
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...{{{{.{{))).)))).....}}}}}}...(((((.....))))).(((((((((((((...[[[[.[[)))).((((....]]]]]].))))(((.....)))))))))))) |