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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00804



RNA: PDB_00804
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] ((((((((([[[))...........]]]((((((.......))))))(((....)))...(((((.......))))))))))))....(((((((..(((.............)))((((((.......))))))(((....)))...(((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....((((((........(((((((............)))))))..)))))).((((((((((((((.((((((((....))))))))....((((((........(((((((............)))))))..)))))).)))))))))))))).))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....((((((.......((.((((((.......)))))).))....)))))).((((((((((((((.((((((((....))))))))....((((((.......((.((((((.......)))))).))....)))))).)))))))))))))).))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......(((........)))((((((.......))))))..............((((.......)))).)))))))............................................................................................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((......))))((((((.......))))))(((....)))...(((((.......))))))))))))....(((((((.......((((......))))((((((.......))))))(((....)))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....((((((.......((.((((((.......)))))).))....)))))).((((((((((((((.((((((((....))))))))....((((((.......((.((((((.......)))))).))....)))))).)))))))))))))).))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((..[[[[)))...]]]]((((((.......))))))((((..[[[[[[[))))....]]]]]]].((((((((....)))))))).(((..[[[[)))...]]]]((((((.......))))))((((..[[[[[[[))))....]]]]]]].))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((((......)))).(((((.......))))).(((....)))....((((((((((((((.((((((((....))))))))......((((......)))).(((((.......))))).(((....)))....)))))))))))))).))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....((((((.......((.(((((((....).)))))).))....)))))).((((((((((((((.((((((((....))))))))....((((((.......((.(((((((....).)))))).))....)))))).)))))))))))))).))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((((......))))((((((.....{{))))))...........}}.((((((((((((((.((((((((....))))))))......((((......))))((((((.....[[))))))...........]].)))))))))))))).))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((((......)))).(((((.......))))).(((....)))....((((((((((((((.((((((((....))))))))......((((......)))).(((((.......))))).(((....)))....)))))))))))))).))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....((((((........(((((((............)))))))..)))))).((((((((((((((.((((((((....))))))))....((((((........(((((((............)))))))..)))))).)))))))))))))).))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((......)))).(((((.((..((.((((.(((.((.(((....((((.((((.(((((.(((((((....))))))).......((((......)))).))))).))..)).)))).))).)).)))....)))).)))).))))).)))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((((......)))).((((.........)))).(((....)))....((((((((((((((.((((((((....))))))))......((((......)))).((((.........)))).(((....)))....)))))))))))))).))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((((......))))(((((........)))))((((...))))....((((((((((((((.((((((((....))))))))......((((......))))(((((........)))))...............)))))))))))))).))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....((((((.......((.(((((((....).)))))).))....)))))).((((((((((((((.((((((((....))))))))....((((((.......((.(((((((....).)))))).))....)))))).)))))))))))))).))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((......))))..((((.......))))))))))).((((...(((((((((((((((.((((((((....))))))))....((((((.......((.((((((.......)))))).))....)))))).)))))))))).))))).))))......
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((((......)))).(((((.((..((.((((.(((.((.(((....((((.((((.(((((((((((((....))))))))......((((......)))).))))).))..)).)))).))).)).)))....)))).)))).)))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....(..)(((((..))))).((((((.((..))))))))(((...)))....((((((((((((((((((((((((....)))))))).).(..)(((((..))))).((((((.((..))))))))(((...))).....)))))))))).))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....((((((.......((..(((((.......)))))..))....)))))).((((((((((((((.((((((((....))))))))....((((((.......((..(((((.......)))))..))....)))))).)))))))))))))).))))))))....
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Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((..((((......)))).(((((.......))))).((((..<<<<<<<))))....>>>>>>>.((((((((....))))))))......{{{{)))...}}}}.(((((.......))))).((((..[[[[[[[))))....]]]]]]]..)))))))....