RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00806

RNA: PDB_00806
Rfam family: -

			UCCCAGUCCACCGCGGUGAGAAGGGGGCAGAGAAACACACGAUCGUGGUACAUUACCUGCC
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.(((..((((((()))))))..)))(((((((((..(((((())))))...)).)))))))
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((....))).))..)))((((..((((.(((....)))))...))..)))))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(.(((....))).)..)))(((((..........................)))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((....(((....)))....)))(((((((..((.(((....)))))...))..)))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(((((....))).)).)))(((((.......(((....))).........)))))
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((....(((....)))....)))(((((.......(((....))).........)))))
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(((((....))).)).)))(((((((.....(((....))).....))..)))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..((((((())))).)).)))(((((.......((((())))).........)))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((.....[[[[[[[[.....)))(((((...........]]]]]]]].......)))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((....(((....)))....)))(((((.......(((....)))(((...))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(((((....))).)).)))(((((..((((.(((....)))))...))..)))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(((((....))).))..)))((((..((((.(((....)))))...))..)))).
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(((((....))).)).)))(((((.......(((....))).........)))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((((((..)))).))))))(((((((((((.((((..))))))...)))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(((((....))).)).)))(((((..((((.(((....)))))...))..)))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((....((((..))))....)))(((((.......((((..)))).........)))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(((((....))).)).)))(((((.....(((......)))((.....)))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(((((....))).))..)))((((..((((.(((....)))))...))..)))).
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(((((....))).)).)))(((((....((.(((....))))).......)))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((((........................))))))))............
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((((........................))))))))............
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(((((....))).))..)))((((..((((.(((....)))))...))..)))).
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(((((....))).))..)))((((..((((.(((....)))))...))..)))).
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(((((....))).))..)))((((..((((.(((....)))))...))..)))).
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.((((..)))).))))))(((((.((((..((((..)))).....)))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((..(((((....))).))..))(((((..(.((.(((....)))))....)..)))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(((((....))).))..)))((((..((((.(((....)))))...))..)))).
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((.((..........))))))................((((....)))).....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((.(([[[[[.....)))))).............]]]]](((.....)))....

---