CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
Home

Methods
Datasets
Rankings
RNA 2D Atlas

Help
FAQ

Contact us
RSS feeds
Twitter

RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00807



RNA: PDB_00807
Rfam family: -

UCGCAGUCCUAUUAAUAGAGAAGCGAGGCAGAGAAACACACGAUCGUGGUACAUUACCUGCC
Reference structure (ext) [ sec struct ] .(((....((((()))))....))).(((((((((..(((((())))))...)).)))))))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..(.(((....))).)..))))(((((..........................)))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((....(((....)))....))))(((((((..((.(((....)))))...))..)))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((....(((....)))....))))(((((.......(((....))).........)))))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((....(((....)))....))))(((((.......(((....))).........)))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((..(((((....))).)).))).(((((((.....(((....))).....))..)))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..((((((())))).)).))))(((((.....(.((((())))))........)))))
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..................))))(((((.......(((....))).........)))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((....(((....)))....))))(((((.......(((....)))(((...))))))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..(((((....))).)).))))(((((..((((.(((....)))))...))..)))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..(((((....))).)).))))(((((..((((.(((....)))))...))..)))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((....(((....)))....))))(((((.......(((....))).........)))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((..)))).)))))))(((((((((((.((((..))))))...)))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..(((((....))).)).))))(((((..((((.(((....)))))...))..)))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..................))))(((((.......((((..)))).........)))))
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..(((((....))).)).))))(((((.....(((......)))((.....)))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..(((((....))).)).))))(((((..((((.(((....)))))...))..)))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..(((((....))).)).))))(((((....((.(((....))))).......)))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((....(((....)))....)))).....................((((.......))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..................))))(((((..........................)))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..(((((....))).)).))))(((((..((((.(((....)))))...))..)))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..(((((....))).)).))))(((((..((((.(((....)))))...))..)))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..(((((....))).)).))))(((((..((((.(((....)))))...))..)))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((....))).)))))))(((((.((((..((((..)))).....)))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..(((((....))).)).))))(((((..(.((.(((....)))))....)..)))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..(((((....))).)).))))(((((..((((.(((....)))))...))..)))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((..................)))..((((..........................)))).
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((..................))).(((((..........................)))))