RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00809

RNA: PDB_00809
Rfam family: -

			GAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUC
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((((((((...))))).)))))))))
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((........))..)))).))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((.....)))).................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((.....))))....(((((...)))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((...))))).)))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((.....))))....(((((...)))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((.....))))....((.....))....
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((.....))))....(((((...)))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((........))..)))).))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((.(((.....)))..)))).))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((.....)))).....(((.....))).
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((.....))))....((((.....))))

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