RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00828

RNA: PDB_00828
Rfam family: Purine

			CGCUUCAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCUUAAACUCUUGAUUAUGAAGUG
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((...(((((((.[[[.[[)))))))........((((((]]..]]]))))))..)))))))))
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))..
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..)))))))).
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..)))))))).
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))..
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(((((((.........))))))........((((((.......)))))).))))))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..)))))))..
DAFS(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))..
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...............(((((.[[[[[[[.......)))))..]]]]]]]....)))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((....(((((......[[.))))).........((((((]].....))))))..)))))))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((..((((((((((((((((((((((((...))))))))..))))))))))))))))))))))))
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((....((((((.......)))))).........((((((.......))))))..))))))...
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..)))))))..
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..)))))))).
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Multilign(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))..
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(({((<<.)}).(((([[[[[[[[[[[[)))))>]]..>)]]]]]]]]]].)))))))))
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((((.(((((((.......)))))))(...))).((((((.......))))))..)))))))..
PETfold_2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...(((((((.......)))))))((....))((((((.......))))))..)))))))).
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((.(((((((.......)))))))(...))).((((((.......))))))..)))))))).
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...(((((((.......)))))))((....))((((((.......))))))..)))))))).
PPfold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((...((((((.........))))))((....))((((((.......))))))..)))))))..
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...((((((.........))))))((....))((((((.......))))))..)))))))).
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...(((((((......).))))))........((((((.......))))))..)))))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))).
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((.....((((.........))))..(((......(((((.......)))))))))))))))..
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))..
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..((((((((.(...).)))))))).......((((((.(...).))))))..)))))))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((.((.((((((.........)))))).....))..(((((.......))))).)).........
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((.((((((.........)))))).....)).((((((.......))))))..)))))))).
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))).
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))).
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))).

---