|
|
|
GGAGCUCGCCCGGGCGAGGCCGUGCCAGCUCUUCGGAGCAAUACUCGGCGGAGCUCGCCCGGGCGAGGCCGUGCCAGCUCUUCGGAGCAAUACUCGGC |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
((a(((((((()))))))aaaa..))((((((..))))))...)AAAAA(([(((((((..))))))<<<<..))((((((..))))))...)]>>>>
|
|
Alterna
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((.........((((....))))....(((....))))))))))))))).(((...)))))))))((((........)))). |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((((...((((....))))..))..))))....))))))))))))))((((((...((((....))))..))..)))) |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.(...((((....))))....).))))....))))))))))))))((((.(...((((....))))....).)))) |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....))))))))))))))((((.(...((((....))))....).)))) |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....))))))))))))))((((.....((((....))))......)))) |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.(...((((....))))....).))))....))))))))))))))((((.(...((((....))))....).)))) |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....))))))))))))))((((.....((((....))))......)))) |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....))))))))))))))((((.....((((....))))......)))) |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....))))))))))))))((((.....((((....))))......)))) |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.(...((((....))))....).))))....))))))))))))))((((.(...((((....))))....).)))) |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....))))))))))))))((((.....((((....))))......)))) |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((...))).((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))((((((((((((((..)))))).)))))))) |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....))))))))))))))((((.....((((....))))......)))) |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.....(((((..)))))......))))....))))))))))))))((((.....(((((..)))))......)))) |
|
NanoFolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((((((((((({<.((.bbb(ddddddd(...cc)))}))..aa))))))))))))))[[[[.AC.ACDD>DDDDDBB...B)))]]]] |
|
Pknots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....))))))))))))))[[[[..)).((((....))))......]]]] |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....))))))))))))))((((.....((((....))))......)))) |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....))))))))))))))((((.....((((....))))......)))) |
|
RDfolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.(((.....((((....)))).........)))..)))))))))))))).(((...........))).......)))... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....))))))))))))))((((.....((((....))))......)))) |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.(...((((....))))....).))))....))))))))))))))((((.(...((((....))))....).)))) |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....)))))))))))))).))......((((....)))).......... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....))))))))))))))((((.....((((....))))......)))) |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((((((.(((((..))))).).)..).))))).))))))))))))))((((((((.(((((..))))).).))))))) |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....))))))))))))))((((.....((((....))))......)))) |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....))))))))))))))((((.....((((....))))......)))) |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((....))))).(((.....((((....))))........((((..(((((....))))).))))....((((....))))......))). |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((....))))).(((.....((((.[[[))))......]]](((..(((((....))))).))).....((((....))))......))). |