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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00868
RNA: PDB_00868
Rfam family:
-
| GCUGGUCCGAUUGACUAGCCGCUGGUCCGAUUGACUAGCCUCCGAGGUCCGA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((((((...))))).))))))))))))............. |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((((((...)))))).)))))))))))............. |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....(((.........))).....)))))))............. |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((...)))))))))))))))))).(((((..))))) |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((((((...)))))).)))))))))))............. |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))...((.....)). |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.[[[[))))))).(((((((.....)))))))......]]]]... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((..((((.(((((...)))))..)))).))))))............. |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(.....(.....)((((.(.............))))).(.((..))...)) |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....))))))).(((((((.....)))))))............. |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((.....))))))..(((((((.....)))))))............. |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....)))))))....((((.....)))).(((.....))).... |