RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00874

RNA: PDB_00874
Rfam family: -

			CGAACUUCGCGCGAACUUCGCGCGAACUUCGCGCGAACUUCGCG
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((([[)))))))))..(((((((((..)))))))))]]
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((...((((((((((.(((....))).)))))))))).....))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((...)))((((((.(((((((((...))))))))).))))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((.(((((((((...))))))))).))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.(((....))).)))))))))).))))..
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.(((....))).)))))))))).))))..
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.(((....))).)))))))))).))))..
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.((((())))).)))))))))).))))..
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((((((.....[[[[[[.)))))))))).]]]]]]
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((.(((((((((...))))))))).))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((...)))((((((.(((((((((...))))))))).))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((.((((((((.....)))))))).))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((.(((((((((...))))))))).))))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))..
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((...)))(((((...((((((((...))))))))...)))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((...))))))))).))))(((((...)))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((.....)))))))).))))((((.....))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((.((((((((.....)))))))).))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........(((((.((((((((.....)))))))).))))).
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((.(((((((((...))))))))).))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((.(((((((((...))))))))).))))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((.((((((((.....)))))))).))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((.((((((((.....)))))))).))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((.((((((((.....)))))))).))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.((((..)))).)))))))))).))))..
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........(((((.((((((((.....)))))))).))))).
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((.((((((((.....)))))))).))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((((.......)))))))......(((.....))).
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((((((((.....))))))))..))).(((.....))).

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