RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00876

RNA: PDB_00876
Rfam family: HIV_FE

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((((((((((((((..))))))))))))...))))))))
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.(((((((((((......)))))))))))....))))).
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....))))))))))))...)))))))
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................................
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.(((((((((((......)))))))))))...)))))).
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.((((((((((((....))))))))))))...)))))).
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....))))))))))))...)))))))
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....))))))))))))...)))))))
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.((((((((((((....))))))))))))....))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....))))))))))))...)))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((..((((((((((((....)))))))))))).....))...
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DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
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MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.((((((((((((....))))))))))))...)))))).
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))))..)))))).
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....))))))))))))...)))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
Multilign(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((.(((((((((((......))))))))..))).))))...
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((...((((((((((......))))))))))(...)))))).
PETfold_2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.(((((((((((......))))))))).))..)))))).
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((...((((((((((......))))))))))(...)))))).
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.(((((((((((......))))))))).))..)))))).
PPfold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((.((((((((......))))))))..)).........
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....))))))))))))...)))))))
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RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....))))))))))))...)))))))
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....))))))))))))...)))))))
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RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((.(((((((((((......))))))))..))).))))...
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..(((((((((((....))))))))))).....))))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((...(((((((((((......))))))))))).....)))).
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(.(((((((((((......)))))))))))...).)))).
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((((((((....)))))))))))....)))))))
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....))))))))))))...)))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.((((((((((......))))))))))....)))))))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((((((((....)))))))))))....)))))))

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