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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00897



RNA: PDB_00897
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((((((.((((..)))).....)))))))))))(((((((((((.((((..)))).....)))))))))))((((((((((((((((..)))))....)))))))))))(((((((((((.((((..)))).....)))))))))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((....))).((...((((((((((((((((((((..(((....))).((...((((((((....))))))))..(((....))).))...))))))))))))))))))))..(((....))).))...))))))))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((((..((((......((((((((((((((((((((..((((..((((......((((((((....))))))))..))))..))))......))))))))))))))))))))..))))..))))......))))))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.......((((((.....((((((((((((((((((((.......((((((.....((((((((....)))))))).......)))))).....)))))))))))))))))))).......)))))).....))))))))))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.......((((((.....((((((((((((((((((((.......((((((.....((((((((....)))))))).......)))))).....)))))))))))))))))))).......)))))).....))))))))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((....)))......))))))))))((((((((((..(((....)))......((((((((((((((((((((..(((....)))......))))))))))))))))))))..(((....)))......))))))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.......((((((.....((((((((((((((((((((.......((((((.....(((((((((()))))))))).......)))))).....)))))))))))))))))))).......)))))).....))))))))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((....)))......((((((((((((((((((((..(((....)))......))))))))))))))))))))..(((....)))......))))))))))((((((((((..(((....)))......))))))))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((....)))......))))))))))((((((((((..((((..((((......((((((((((((((((((((..(((....)))......))))))))))))))))))))..))))..))))......))))))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((....))).((...((((((((((((((((((((..(((....)))......))))))))))))))))))))..(((....))).))...))))))))))((((((((((..(((....)))......))))))))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((....)))......))))))))))((((((((((..(((....)))......))))))))))((((((((((..(((....)))......))))))))))((((((((((..(((....)))......))))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((....)))......))))))))))((((((((((..(((....)))......))))))))))((((((((((..(((....)))......))))))))))((((((((((..(((....)))......))))))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.......((((((.....((((((((((((((((((((.......((((((.....(((((((((..))))))))).......)))))).....)))))))))))))))))))).......)))))).....))))))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((....)))......))))))))))((((((((((..(((....))).((...((((((((((((((((((((..(((....)))......))))))))))))))))))))..(((....))).))...))))))))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ......((((..(((....)))......))))......((((((((((..(((....)))......))))))))))((((((((((..(((....)))......))))))))))......((((..(((....)))......))))......
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((((..((((......((((((((((((((((((((..((((..((((......((((((((....))))))))..))))..))))......))))))))))))))))))))..))))..))))......))))))))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((....))).((...((((((((((((((((((((..(((....)))......))))))))))))))))))))..(((....))).))...))))))))))((((((((((..(((....)))......))))))))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((..(((....))).((...((((((((((((((((((((..(((....)))......))))))))))))))))))))..(((....))).))...))))))))).((((((((((..(((....)))......))))))))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((....)))......))))))))))((((((((((..(((....)))((....((((((((((((((((((((..(((....)))......))))))))))))))))))))..(((....)))))....))))))))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.(.((.((((((..(((.(((((((((..)))))))))..((((..))))...((.((((((((((((((((((((..........((...).)))))))))))))))))))))...))))))))))))).)))))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((....)))......((((((((((((((((((((..(((....)))......))))))))))))))))))))..(((....)))......)))))))))).(((((((((..(((....)))......))))))))).
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((....)))......))))))))))((((((((((..(((....))).((...((((((((((((((((((((..(((....)))......))))))))))))))))))))..(((....))).))...))))))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((...((((..(((......((((((((....))))))))..))).(((....)))..((((((((....)))))))).)))).(((....)))..((((((((....)))))))).....((((....)))).))))))))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((((((....)))..((((((((....))))))))........))))......((((((((....))))))))..(((((((....)))..((((((((....))))))))........))))......))))))))))