RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00919

RNA: PDB_00919
Rfam family: RNaseP_bact_a

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Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((((.(((((((((....)))))))))..............((..((((.((((..((((((((..((((((((((((((..........))))))...((((((..((..(((...)))...))))))))......)))))))).....(((.....)))...(((((((................)))))))....)))).)))).)))))))).)).....)))))))((((..((.(((((....)))).).)).)))).....)))))))))))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((((((((((((((....)))))))))......(((((.((((((.((..((((...(((((.((((((((((.....))))))......)))))))))..))))...)))))))).(((...((((((.....((((....................))))..(((((((................))))))).....))))))...)))..))..)))...))))))))((((......((((....))))......)))).....)))))))))))))
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CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............(((((((.((((((((......))))))))................((((((.((......)))))).)).......((((((..........))))))....................................................................(((((((...(........)...)))))))((((((..........))))))........)))))))..................................................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((........(((((((((....)))))))))....(((.((((((((((((((.((......)))))).....(((((((((((..........))))))...((((((....................))))))......))))))))))...(((.....)))..(((((..((...........(((.((.....((((((.((....)).)))))).............)).))).....))....)))))......)))))))).).)))))))))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((((((((((((((....))))))))).((.....)).((((((..(((((((..(..((((((.((......(((((((..........)))))).)(((()))).)).)))))).)....)))))))..........)))))).....(((.....)))...(((((((...(........)...)))))))((((((.((....)).)))))).......))))))))((((..((.(((((....)))).).)).)))).....)))))))))))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((((((((((((((....))))))))).(((...)))...(((..[[[[....)))....]]]](((((((((.....))))))........[[[[[[.[[[[)))..]]]]..]]]]]]...(((((......((((....................))))..(((((((................)))))))[[[[[[))))).....]]]]]].......))))))))((((......((((....))))......)))).....)))))))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((((.(((((((((....))))))))).(((...))).((((((.((((.((......))))))...((((((.....)))))).(((....((((((.((((.....))))..))))))...)))..((......)).)))))).....(((.....)))...(((((((................)))))))((((((.((....)).))))))........)))))))((((......((((....))))......)))).....)))))))))))))
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MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((..((.(.((((.(((((((((((((((........)))))))............(.(((..(((.((((((...))))))..((....).........)..........((...((((.....))))..).).......((((.......)))))))).)))...(((...(..((((((.........)))))).........)..)))..(((..........)).).........)))))))).....................................)))))))))....
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................
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McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.((((((((((((((((((..))))))))))......((((.((((((..(((((((.....(((((......((((.((((((..........)))))).((((..)))))))))))))......)))))))..........))))))..............)))).(((((((................)))))))((((((..........)))))).......))))))))((((..((((........))))......)))).....)))))))))))))
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RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((((((((((((((....)))))))))............((((((.....((((...(((((.((((((((((.....))))))......)))))))))..)))).....)))))).......((((((.....((((....................))))..(((((((................))))))).....)))))).((((...))))......))))))))((((......((((....))))......)))).....)))))))))))))
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RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((((.(((((((((....))))))))).((.....))....((..((((.((((..((((((((..((((((((((((((..........))))))...((((((..((..(((...)))...))))))))......)))))))).....(((.....)))...(((((((...(........)...)))))))....)))).)))).)))))))).)).....)))))))((((..((.(((((....)))).).)).)))).....)))))))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((..(((((((((((((((...(((.(((.(((..((.((((..(((((((.((......)))))).)))..))))....))...))).....))).)))))))))))).))))))))))((.((((.(((((...(((..((..((.....(((.....)))...((((....))))...))..))..)))....((((((.((....)).))))))...............))))).....((((....))))........)))).)))))))))))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((((.(((((((((....))))))))).((.....)).(((((((((((.((......)))))).(..(((((.....)))))..)....))((((((.((((.....))))..))))))...(((..((....)).)))))))).....(((.....)))...(((((((...(........)...)))))))((((((.((....)).))))))........)))))))((((..((.(((((....)))).).)).)))).....)))))))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((...((.(.(((((((....))))))))))...(((.((((((...((...))(((.(((((((((.((((...(((((((((........))))))).))((((((..(((((........)))))))))))...((((....................))))..((((((((..............)))))))))))))))).)))))))).((((...............(((((((((..)))))))))))))).))))))))))))))))))))))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........................................................................................................................................................................................(....).(..)........(........................................)...........(..........)..............(........)....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((((.(((((((((....))))))))).((.....))........((((.((((..((((((((...(((((((((((((..........)))))).........................................)))))))......(((.....)))...(((((((...(........)...)))))))....)))).)))).))))))))........)))))))((((......((((....))))......)))).....)))))))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((((.(((((((((....))))))))).((.....))....((..((((.((((..((((((((...(((((((((((((..........))))))...((((((..((..(((...)))...))))))))......)))))))......(((.....)))...(((((((................)))))))....)))).)))).)))))))).)).....)))))))((((......((((....))))......)))).....)))))))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............(((......(((((((((....))))))))).......)))..(((...((((.((......))))))...((((((.....))))))........((((((.((((.....))))..))))))..))).(((((...((((....................))))..(((((((................)))))))...(((..........))).((((........)))).))))).....((((....))))....((((.((.....))))))......
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((..aaa..))))))..(((((((((....)))))))))......((((...{{{{{((((.(([[[...)))))).....]]].(((.(((..........))).((((.((((.....))))..)))).....<<<<<)))...((((....>>>>>...........))))..((((((..............))))))..)))).(((}}}}}.....))).((((........))))......AAA..((((....))))....((((.((.....))))))......

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