|
|
|
GACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCAGACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCA |
Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))...(((((..(((((.....)))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))...
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......))))))))))))))..(((....))).))))))))))).)))))))))))). |
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......)))))))))))))).((((....))))))))))))))).)))))))))))). |
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..................................................................................................................(((.......)))..))))))). |
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))......((((.......)))).))))))).(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))......((((.......)))).))))))). |
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......)))))))))))))).((((....))))))))))))))).)))))))))))). |
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((..[[[..))))........]]]((((....))))(((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......)))))))))))))).((((....))))))))))))))).)))))))))))). |
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))......((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......)))))))))))))).((((....))))))))))))))).)))).))))))). |
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).((((((....).))))).....(((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......)))))))))))))).((((....))))))))))))))).)))))))))))). |
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(([[[.....))]]].......(((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......)))))))))))))).((((....))))))))))))))).)))))))))))). |
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......)))))))))))))).((((....))))))))))))))).)))))))))))). |
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......)))))))))))))).............))))))))))).)))))))))))). |
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......)))))))))))))).((((....))))))))))))))).)))))))))))). |
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((.((((((((((..(((............))).)))))))))).((((....))))))))))))))).)))))))))))). |
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......)))))))))))))).............)))))))))))).))))))))))). |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).((((((....).))))).....(((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......)))))))))))))).((((....))))))))))))))).)))))))))))). |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((.......)))).((((....)))).)).......(((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......)))))))))))))).((((....))))))))))))))).)))))))))))). |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).((((((....).))))).....(((((((((((.(((((.(((((((((((....)((((.......)))))))))))))).((((....))))))))))))))).)))))))))))). |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......))))((((((.((..))))))))....(((((((((((.((((((((((((((((.(((((((.(...)))))))))))))))))).))...........)))))))))).)))))))))))). |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......)))))))))))))).((((....))))))))))))))).)))))))))))). |
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......))))))))))))))..(((....))).))))))))))).)))))))))))). |
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......))))..((((((((..(((....))).(((((.......))))).)))))))).(((....((((.......)))).((((....)))).....)))..(((((.......)))))))))))). |
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). |