RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00967

RNA: PDB_00967
Rfam family: -

			GCCGGGGUGGCGGAAUGGGUAGACGCGCAUGACAUCAUGUGCGCAAGCGUGCGGGUUCAAGUCCCGCCCCCGGCACCAGCCGGGGUGGCGGAAUGGGUAGACGCGCAUGACAUCAUGUGCGCAAGCGUGCGGGUUCAAGUCCCGCCCCCGGCACCA
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((..(((...........)))((((((..))))))((....))..(((((.......))))))))))))....(((((((..((((.........))))((((((()))))))((....))..(((((.......))))))))))))....
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((..((((....((((((((....))))))))....((((((..((((....(((((((((((....))))))..)))))..))))....((((((((....))))))))....))))))..))))....)))))))))))....
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................(((((((((..(((((((((.......(((((.......)))))(((((((....)))))))................)))))))))..))))))))).......(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(((.......................................................................................................................((.......))))))))))))....
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(((...........)))((((((...((((((((.....(((((((.......)))))(((((((....))))))).......)).......))))))))...))))))((....))..(((((.......))))))))))))....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((.......((...(((((((((..(((((((((...(((.(((((.......)))))(((((((....)))))))...).......))...)))))))))..)))))))))...))))(((((.......))))))))))))....
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.....((((.....[[[(((((((....)))))))(((....)))..))))..]]](((((((((((....))))))..)))))...........(((((((....)))))))........(((((.......))))))))))))....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.((.....(((.((((((......((((((((..((((((.(((...((.(((((((((((....))))))..))))).)).....))).))))))......))))))))..)))))).)))...)).)))))))))))....
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.((..(..(((.((((((......((((((((..((((((.((((..((.(((((((((((....))))))..))))).))..)..))).))))))......))))))))..)))))).))))..)).)))))))))))....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((............(((((((((..(((((((((.........(((.......)))(((((((((....)))))))..))............)))))))))..))))))))).........(((.......))))))))))))....
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........((.((((((......((((((((..((((((.((.......(((((((((((....)))))))..)))).........)).))))))......))))))))..)))))).)).......)))))))))))....
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................(((((((((..))))))))).......(((((.......)))))(((((((....)))))))................(((((((((..))))))))).......(((((.......))))))))))))....
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..(((((.((.....(((.((((((......((((((((..((((((.(((...((.(((((((((((....)))))))..)))).)).....))).))))))......))))))))..)))))).)))...)).)))))))))))....
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((........(((.((((((......((((((((..((((((.(((......(((((((((((....)))))))..))))........))).))))))......))))))))..)))))).)))......)))))))))))....
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..(((((..........((((((((....))))))))....((((((..........(((((((((((....)))))))..))))..........((((((((....))))))))....))))))..........)))))))))))....
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.((...(..((.((((((......((((((((..((((((.((..(.((.(((((((((((....))))))..))))).))...)..)).))))))......))))))))..)))))).))..).)).)))))))))))....
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((.(((.....((...((((((((....))))))))...))..(((((.......)))))..))).))))..))))((((.(((.....((...((((((((....))))))))...))..(((((.......)))))..))).)))).
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.((..((..(...(((((((((..((((((((....))..(((.(..((..(((((.(((((((....)))))))))).))..))..)...)))))))))..))))))((....))..))).)..))..))))))))).)))....
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..(((((((.((((...(((((((((..)))))))))..((((((((......))).(((((((.(((....))))))))))(..).........(((((((((..)))))))))...)))))...))))...)))))))))))))....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((...((....((....(.((((((((....))))))))).............((.....(((.((((((....))))))...)))...))....(.((((((((....))))))))).............))......)).))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..(((((.((.....(((.((((((......((((((((..((((((.(((...((.(((((((((((....))))))..))))).)).....))).))))))......))))))))..)))))).)))...)).)))))))))))....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.......(((.((....((((((........))))))..(((((.(((.......)))..(((((((....)))))))................)))))...))..))).(((....))).(((((.......))))))))))))....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.....))).....(((....((((.(((....))).(((....))).(((((.......)))))(((((((....)))))))................)))).(((....))).(((....))).(((((.......))))).))).......

---