|
|
|
GGGACCAGGGGUGCUUGUUCACAGGCUGAGAAAGUCCCUUUGAACCUGAACAGGGUAAUGCCUGCGCAGGGAGUGUCGGGACCAGGGGUGCUUGUUCACAGGCUGAGAAAGUCCCUUUGAACCUGAACAGGGUAAUGCCUGCGCAGGGAGUGUC |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
..(((.(((((((((((....)))))......)).))))....((((((.((((......)))))).))))...)))..(((.(((((((((((....)))))......)).))))....((((((.((((......)))))).))))...)))
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((((..(((.((((.....)))).)))..))))))..(((....)))......((((((((((.(...(((((..((((((..(((.((((.....)))).)))..))))))..))))).........).))))))))))..)).)) |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.......(((((....))))).......))))).....((((.....))))....((((((((((.......(((((.......(((((....))))).......))))).....((((.....))))....))))))))))....... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((..((((((.((((.((((.....)))).)))).))))))..))..............((((((((((.....(((((..((((((.((((.((((.....)))).)))).))))))..)))))...........))))))))))....... |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............(((((.................................................................................)))))..................(((...((((......))))...)))....... |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.......((((......)))).......)))))..(...(((....)))..)(((((((((((((.....(((((..((((((.((((...............)))).))))))..)))))...........))))))))))...))). |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....((((((.((((.((((.....)))).)))).)))))).((((.....))))....((((((((((..((.(((((..((((((.((((.((((.....)))).)))).))))))..))))))).........))))))))))....... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....((((((..[[[[[[[[..((((.....))))))))))....]]]]]]]]......((((((((((.....(((((..((((((..(((.((((.....)))).)))..))))))..)))))...........))))))))))....... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.......((((((..((((((.......(((((......((((..((((......))))..)))).......))))).......))))))..)))))).......)))))......((((..((((......))))..))))....... |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.......(((((....))))).......))))).....((((.....))))..(.((((((((((.(...(((((..((((((..(((.((((.....)))).)))..))))))..))))).........).)))))))))).)..... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((({{{{{{.(([[..[[[...))]]]..]])))}}}}}}..((.......)).....<<<<<<<<<<...................(((.................))).))......................>>>>>>>>>>....... |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((.((((((((((..).))))))))))))))..((((((..))))))..(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..).)))))))))))))))))))))))......)))))))))))))))))).))) |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.......((((((..((((((.......(((((......((((..((((......))))..)))).......))))).......))))))..)))))).......)))))......((((..((((......))))..))))....... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.......((((((..)))))).......)))))......((((..))))......((((((((((.......(((((.......((((((..)))))).......)))))......((((..))))......))))))))))....... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.......(((((....))))).......))))).....((((..[[[))))....((((((((((.......(((((.......(((((....))))).......))))).....((((.....))))....))))))))))...]]]. |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((...{{{{{{..{{{{{{.......{{{{{))))..((((..((((......))))..)))).......}}}}}[[[[...}}}}}}..}}}}}}.......)))))]]]]..((((..((((......))))..))))....... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.......((((((..((((((.......(((((......((((..((((......))))..)))).......))))).......))))))..)))))).......)))))......((((..((((......))))..))))....... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.......(((((....))))).......))))).....((((.....))))..(.((((((((((.(.(((((((..((((((..(((.((((.....)))).)))..))))))..)))).)))......).)))))))))).)..... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.......((((((..((((((.......(((((..((..((((..((((......))))..))))...))..))))).......))))))..)))))).......))))).((...((((..((((......))))..)))).)).... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.......(((((....))))).......))))).....((((.....))))..(.((((((((((.(.(((((((..((((((..(((.((((.....)))).)))..))))))..))))).))......).)))))))))).)..... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((((..(((((((.......)))))))..)))))).(((((..))))).(.(.((((((((((.(.((((...))((((((..(((((((.......)))))))..)))))).(((((..))))).)).))))))))))).)).))) |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.......(((((....))))).......))))).....((((.....))))..(.((((((((((.(...(((((..((((((..(((.((((.....)))).)))..))))))..))))).........).)))))))))).)..... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.......((((((..((((((.......(((((......((((..((((......))))..)))).......))))).......))))))..)))))).......)))))......((((..((((......))))..))))....... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((((.(((((....)))))........(((((....((((.....))))....(((((((.....))).))))...))))).(((((....)))))........))))).....((((..((((......))))..))))....... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((...[[[.(((((....)))))[[[....))))).....((((.....))))....(((((((.....))).))))..((((....)))).]]].((((....(((..]]])))..((((.....))))...))))((((.....)))). |