|
|
|
GGCGGCGUAGCUCAGCUGGUCAGAGCGGGGAUCUCAUAAGUCCCAGGUCGGAGGUUCGAGUCCUCCCGCCGCCACGGCGGCGUAGCUCAGCUGGUCAGAGCGGGGAUCUCAUAAGUCCCAGGUCGGAGGUUCGAGUCCUCCCGCCGCCAC |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))..((.((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))).))..
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........))))..((((.......))))......(((((((((((.(((((((((((....))))))..((((.........)))).(((((.......))))).....))))))))))).)))))))))).).) |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((((((((....))))))..((((.........)))).(((((.......))))).....))))))))))).)))))))))))).. |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.((((((..((((.(((((.......))))).....(((((.......)))))((((((....))))))..)))).))))))..)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).. |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((...((((.........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).............................................................................)))))).. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.((((((..((((.(((((.......))))).....(((((.......)))))((((((....))))))..)))).))))))..)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).. |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.((((((..((((.(((((.(....)))))).....(((((.......)))))((((((....))))))..)))).))))))..)))).(((((.(....)))))).....(((((.......)))))))))))).. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.[[[.....)))).(((((.......))))).]]].(((((((((((.(((((((((((....))))))..((((.........)))).(((((.......))))).....))))))))))).)))))))))))).. |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((((((((....))))))..((((.........)))).(((((.......))))).....))))))))))).)))))))))))).. |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((((((((....))))))..((((.........)))).(((((.......))))).....))))))))))).)))))))))))).. |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((..((((...((((.(((((.......))))).....(((((.......)))))((((((....))))))..))))..))))...)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((((((((....))))))..((((.........)))).(((((.......))))).....))))))))))).)))))))))))).. |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..(((...(((((((((((.(((((.......))))).....(((((.......)))))(((((((..)))))))..))))...)))))))))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((((((((....))))))..((((.........)))).(((((.......))))).....))))))))))).)))))))))))).. |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........)))).(((((.(....)))))).....(((((((((((.(((((((((((....))))))..((((.........)))).(((((.(....)))))).....))))))))))).)))))))))))).. |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.((((((..((((.(((((.......))))).....(((((.......)))))((((((....))))))..)))).))))))..)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((((((((....))))))..((((.........)))).(((((.......))))).....))))))))))).)))))))))))).. |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((...)))).........(((((.......))))).....(((((((((((.(((((((((((....))))))..((((.........)))).(((((.......))))).....))))))))))).)))))))))))).. |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((((((((....))))))..((((.........)))).(((((.......))))).....))))))))))).)))))))))))).. |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.....((((((((.(((((....).)))......((..))..((((((...)..)))))(((((((..))))))).))).))))))....((((....).)))......((..))..((((((...)..)))))))))))).. |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........)))).((((.........)))).....(((((((((((.(((((((((((....))))))..((((.........)))).((((.........)))).....))))))))))).)))))))))))).. |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((((((((.(((((((((((....))))))..((((.........)))).(((((.......))))).....))))))))))).)))))))))))).. |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).(((((....)))))...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).)))))).. |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.[[[[[[..)))).((((.((....)))))).....(((((.......))))).(((((....)))))...((((.]]]]]]..)))).((((.((....)))))).....(((((.......)))))))))))).. |