RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_00994

RNA: PDB_00994
Rfam family: -

			AGUCCCGUGGGGUAGUGGUAAUCCUGCUGGGCUUUGGACCCGGCGACAGCGGUUCGACUCCGCUCGGGACUAAGUCCCGUGGGGUAGUGGUAAUCCUGCUGGGCUUUGGACCCGGCGACAGCGGUUCGACUCCGCUCGGGACUACC
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((..((............)).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))...
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((.......)))))((((((.......))))))...(((((.(((...(((((((((.((((..((((((((((.......))))))).)))..)))).)))).....)))))..)))..))))))))))))...
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.......)))).((((((.......))))))...(((((.......)))))((((.((((((((.(((((((.......))))))).)))))).)).))))......((((.......)))).)))))))...
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..(((.........))).((((((.......))))))......((.......))...........................................................................))))))....
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(((..........)))((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).(((((((..(((..........)))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))...
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((.......)))))((((((.......))))))...(((((.......)))))((((.((((((((.(((((((.......))))))).)))))).)).)))).....(((((.......))))))))))))...
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((.......)))))((((((.......))))))...(((((.((((..(((((((((.((((..((((((((((.......))))))).)))..)))).)))).....))))).))))..))))))))))))...
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((..........))).((((((.......))))))...(((((.((((..(((((((((.((((((((.(((((((.......))))))).)))).)))).)))).....))))).))))..))))))))))))...
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(.((.(((.(.((((((((((((((..((.((((((...((.(((((.(((((.(.((((((...)))))).).)).))).).))))))))))))))..)).))))))...)).))))).))))).).)))))))...
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(((.........))).((((((((..((.((((((...(((((.......)))))((((((...)))))).(((((.......)))))))))))))..)).))))))...(((((.......))))))))))))...
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((..........))).((((((.......))))))...(((((.((((..(((((((((.((((((((.((((((.........)))))).))))).))).)))).....))))).))))..))))))))))))...
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.......))))(((((((.......)))))))..(((((.((((..(((((((((((...))))))..((((.......))))(((((((.......)))))))..))))).))))..))))))))))))...
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((<(([[.((..aaa((((((({{{.{{{)))))))))(((((.bbbb..)))))..AAA[[[[[)>))))))))))ccccc..}}}(((((((.]]]]].)))))))]]ccccc.BBBB))CCCCC.}}}CCCCC.
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((.......)))))((((((.......))))))...(((((.((((..(((((((((.((((((((.(((((((.......))))))).)))))).)).)))).....))))).))))..))))))))))))...
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((.((....).)))).((((((.......))))))...(((((.((((..(((((((((.((((((((.((((((((....).))))))).))))).))).)))).....))))).))))..))))))))))))...
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.................(((((((.......)))))))..(((((.((((..(((((((((...((((((.(((((((.......))))))).))))))....))))).....)))).))))..))))))))))))...
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(.((.(((.(.((((((((((((((..((.((((((...((.(((((.(((((.(.((((((...)))))).).)).))).).))))))))))))))..)).))))))...)).))))).))))).).)))))))...
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.(((((((.......))))))).))))).(((.((((.....(((((.((((..(((((((((.((((((((.(((((((.......))))))).)))).)))).)))).....))))).))))..))))))))).)))..
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(.((.(((.(.((((((((((((.((..((((((((...((.(((((.(((((.(.((((((...)))))).).)).))).).)))))))))))).))..))))))))...)).))))).))))).).)))))))...
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.((((.(((((..(..((((((((.(....))))))...((((((..((.((((((..(((((...))))))))))).))..)).)..)))(((((.(....))))))...)))..)..))))))).)))))))))...
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(.((.(((.(.((((((((((((.......((((((...((.(((((.(((((.(.((((((...)))))).).)).))).).)))))))))))).......))))))...)).))))).))))).).)))))))...
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((..........))).((((((.......))))))...(((((.((((..(((((((((.((((((((.(..(((.........)))..).)))).)))).)))).....))))).))))..))))))))))))...
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((...((((.......)))).((((((.......))))))...(((((.......))))).((((.....))))...((((.......)))).((((((.......))))))...(((((.......))))).))))))...
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((...((((.......)))).((((((..[[[[[))))))...(((((]]]]]..))))).)))))).(((((((..((((.......)))).((((((..{{{{{))))))....((((}}}}}..)))).)))))))...

---