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| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))(((((((((..((((.........))))((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))))) |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.(.(())).))))((((((.......))))))...(((((((((((((((.((((((((())))))))..((((.(.(())).))))((((((.......))))))...))))))))))))))).)))))))).. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((...((((..((((((((((.......))))))....((((.......)))).((((((....))))))..))))...))))..))))((((((.......))))))....((((.......)))).))))))).. |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.....(...((((((((((.......))))))....((((.......))))..(((((....)))))...))))....)....))))((((((.......))))))....((((.......)))).))))))).. |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((...[[[[..))))((((((.......))))))....((((((((((((((..(((((((..)))))))..((((...]]]]..))))((((((.......))))))....))))))))))))))..))))))).. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((...((((...((((..((((((((((.......))))))...(((((..((..((((....))))..)).)))))..))))...))))..))))((((((.......))))))...(((((.......))))).)))))).. |
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ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((...((((..((((((((((.......))))))...((((([[[[[[.)))))((((((....))))))..))))...))))..))))((((((.......))))))...(((((]]]]]].)))))))))))).. |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Sfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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UNAFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((...((((..((((((((((.......))))))...(((((..((..((((....))))..)).)))))..))))...))))..))))((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).. |
|
Vsfold4
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((...((((...((((..((((((((((.......))))))...(((((.......))))).(((((....)))))...))))...))))..)))).(((((.......)))))....(((((.......))))).)))))).. |
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Vsfold5
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((...((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.[[[[[.)))))((((((....))))))..((((.........)))).(((((.......))))).....((((]]]]]..))))..)))))).. |
