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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_01002



RNA: PDB_01002
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((....(((.....)))...((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...(((((((((((((((.......))))......)))))))...))))))))))))))....
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))...........
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((..[[[..)))).(((((..]]]..))))).....(((((.......))))))))))))....
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((((.......))))...[[[[[[[........)))))(((((.......))))).]]]]]]]...
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).((((((....).))))).....(((((.......))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((...))))))(((((....))))))))))))))((((((...)..))))).((((..))))
MXScarna(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((.......)))..((((((....).))))).....(((((.......))))))))))))....
Mastr(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (..((((..((((.......)))).(((((.......)))))..........(((((.......)))))))))).
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.........)))..((((.......))))......(((((.......))))))))))...)).
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PPfold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))(((((....)))))(((....)))((((.......)))).)))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))..((([[[[[....)))]]]]])))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ........(((((.........)))))(((((((..............((((.......))))..)))))))...
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
RNASampler(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
RNAalifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...).
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....