RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_01009

RNA: PDB_01009
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((([[[)).......]]]..((((.......))))......(((((.......))))))))))))
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((.((.(((((((....))))))).)).))))..(((((.......))))))))))))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.((((((...))))))((((((.......)))))).....((((.......))))))))))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((((...)))))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.((((.((.(((((((....))))))).)).)))).))((((.......))))))))))))
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(((.........)))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(((((.....))))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.((((.((.(((((((....))))))).)).)))).))((((.......))))))))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((((...))))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...(((((((.(((((((....)))))))))).))))...((((.......))))))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.((((.((.(((((((....))))))).)).)))).))((((.......))))))))))))
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IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.(({{{{....{{{))(([[[[))..}}}]]]]}}}}...((((.......))))))))))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))(((((...)..))))))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(.((((.((.(((((((....))))))).)).)))).)(((((.......))))))))))))
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NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.((((.<<<<<(.[[.[[[[[[)))))].]]]]]].]>>>>>((({{{.)))}}}))))))))
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PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(((((.....)))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((.((.(((((((....))))))).)).))))..(((((.......))))))))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((....(((((((....)))))))....))))..((((((....).))))))))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((................((((((((((................)))))))...)))..)))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((((...))))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))
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RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((.((.(((((((....))))))).)).))))..(((((.......))))))))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.((((.((.(((((((....))))))).)).)))).))((((.......))))))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.((.(((((((.(((((((..)))))))).)).)))))).(((((...)..))))))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.((((.((.(((((((....))))))).)).)))).))((((.......))))))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((.((.(((((((....))))))).)).))))..(((((.......))))))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(((((.....))))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(((((.....))))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))

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