RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_01076

RNA: PDB_01076
Rfam family: -

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.((((((((((((....(((((.((((((((((((....)))))))))))).)))))........((((((....(((((.(((((....))))).)))))..)))))).....)))))).)))))).(((((((((((.......)))))....(((((((((((((..((((((((((..)))))))))).))))).))))).)))...))))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((((((.....(((((..((((((....))))))..)))))..((((((......)))))).(((((....)))))....((((..........)))).)))))))....)))))))..((((((((((.....))))))........((((((((....(((((..........)))))...)))).))))........))))..
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(.(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((......(((.((......((....))..)).))).....)))).))))))).)..)))))))..((((((((((.....))))))..(.(((.((((((((....(((((..(....)..)))))...)))).))))..))).).))))..
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......................(((((..((((((....))))))..))))).....(..........)................(....)..............................................................................................................................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(.(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))((...)).(((((.....((((....(((....)))....))))...))))).))))))).)..)))))))..(((.(((((.......)))))........(((((((.....(((((..........)))))....))).)))).........)))..
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(.(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((...(..(((.(((.....((....))).)).)))....))))).))))))).)..)))))))..((((((((((.....))))))..(.(((.((((((((....(((((..(....)..)))))...)))).))))..))).).))))..
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((.........((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....)))))))..((((((((((.....))))))....(((.((((((((..(((..(((......)))..)))...)))).))))..)))...))))..
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))(((......)))....(((((....)))))....((((..........)))).)))))))....)))))))..((((((((((.....))))))....(((.((((((((..(((..(((......)))..)))...)))).))))..)))...))))..
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))..................((((....(((....)))....)))).........)))))))....)))))))..((((((((((.....)))))).....((.((((((((....(((((..........)))))...)))).))))..))....))))..
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McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((((((.....(((((..((((((....))))))..)))))..((((((......)))))).((((((..))))))....((((..........)))).)))))))....)))))))..((((((((((.....))))))........((((((((....(((((..........)))))...)))).))))........))))..
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((..((((((((...((.((((((((bbbbbb.bbbbbb(.aa.aa)))))))))).AA..[[[[...((((((..))))))....[[{((.<<<<....)BBBBBB((((..)))).}))))))).)]]ccccccc(....)>cccccc))).BBBBBB.)CCCCCCCCCCCAA(((((...))))).]]]].......CC....>>>)..
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((.((....))((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....)))))))..((((((((((.....))))))....(((.((((((((..(((..(((......)))..)))...)))).))))..)))...))))..
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))(((......)))....(((((....)))))....((((..........)))).)))))))....)))))))..((((((((((.....))))))....(((.((((((((.((((..(((......)))..))).).)))).))))..)))...))))..
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((((((.....(((((..((((((....))))))..)))))..((((((......)))))).(((((....)))))....((((..........)))).)))))))....)))))))......((((((.....))))))........((((((((....(((((..........)))))...)))).))))..............
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RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((.((....))((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....))))))).((...((((((.....))))))........((((((((..(((..(((......)))..)))...)))).))))..))..........
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(((((.((((((((((..(((((......)))))..)))))))))).((..))((((((..))(((((..))))).((((.(........))))).)))))))))..).))))))))...(((..........))).((((...((((((((((((.(...(((((........)))))...))))).))))).)))....))).)
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((.........((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....)))))))..((((((((((.....))))))....(((.((((((((....(((((..(....)..)))))...)))).))))..)))...))))..
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((((((((..(((((..((((((....))))))..)))))..))).....((((.((....))((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....)))))))..((((((((((.....))))))....(((.((((((((..(((..(((......)))..)))...)))).))))..)))...))))..
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.((((..((((.....))))..((((((....))))))(((....))).((((......))))...(((((....))))).....)))).(((((............)))))..)))))....((((..((((.....)))).(((....)))(((((((....(((((..........)))))...)))).))).........))))..
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((...[[[[[[[.....)))((((((((((....))))))(((....))).((((......))))...(((((....)))))....{{{{...))))...}}}}...(((....))).]]]]]]]((((..((((.....)))).(((....)))(((((((....(((((..........)))))...)))).))).........))))..

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