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UGAAGAGUUUGAUCAUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGCAGGCCUAACACAUGCAAGUCGAACGGUCCGGAAGAAGCUUUCUUUUGGACAGUGGCGGACGGGUGAGUAAUGUCUGGGAAACUGCCUGAUGGAGGGGGAUAACUACUGGAAACGGUAGCUAAUACCGCAUAACGUCGCAAGACCAAAGAGGUUUUCUUGCCAUCGGAUGUGCCCAGAUGGGAUUAGCUAGUAGGUGGGGUAACGGCUCACCUAGGCGACGAUCCCUAGCUGGUCUGAGAGGAUGACCAGCCACACUGGAACUGAGACACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGCACAAUGGGCGCAAGCCUGAUGCAGCCAUGCCGCGUGUAUGAAGAAGGCCUUCGGGUUGUAAAGUACUUUCGCGGGGAGGAAGGGAGCGACGAGCUCAUUGACGUUACCCGCGAAGUAGCACCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGUGCAAGCGUUAAUCGGAAUUACUGGGCGUAAAGCGCACGCAGGCGGUUUGUUAAGUCAGAUGUGAAAUCCCCGGGCUCAACCUGGGAACUGCAUCUGAUACUGGCAAGCUUGAGUCUCGUAGAGGGGGGUAGAAUUCCAGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCUGGAGGAAUACCGGUGGCGAAGGCGGCCCCCUGGACGAAGACUGACGCUCAGGUGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGUCGACUUGGAGGUUGUGUCUCGUGGCUUCCGGAGCUAACGCGUUAAGUCGACCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCAAAUGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGUCUUGACAUCCACGGAAGUUUUCAGAGAUGAGAAUGUGCCUUCGGGAACCGUGAGACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUUGUGAAAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCCUUUGUUGCCAGCGGUCCGGCCGGGAACUCAAAGGAGACUGCCAGUGAUAACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUACGACCAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCGACUACAAAGAGAAGCGACCUCGCGAGAGCAAGCGGACCUCAUAAAGUGCGUCGUAGUCCGGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGUGGAUCAGAAUGCCACGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUGCAAAAGAAGUAGGUAGCAACCUUCGGGGCGCUUACCACUUUGUGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA |
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|
Afold
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Carnac(20)
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CentroidAlifold(seed)
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((.((((((((((.....)))))))))).)))))......(((......(((((((..((...(((((((.(.((.....((((((....))))))......)).).....(((....)))(...)...........)))))))..)).)))))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....))))(((((((((...(....((((.....)))).....)....)))))))))..(((((......(((((.....((....)).......)))))))))).)))))))))).......((((((.....(.((((...(((.(((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((.(...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....))..))))))..)))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((((.....)))))))))...((....)).....)))))))))))))((.....((((....))))....)).........(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((..(((((((....))))))).(.((....)).)))))).))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((.....)))))....)))))))..((.(((((....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)......((((((........((...(((....)))...)).(((............)))))))))(....(((((((........)))))))....).....))))).....(((((((.........)))))))......))...)))))))))).))....(..((...((((.(((..((((((((((((....((((((.....((....))..))))))...))))))))))))..))).))))....))...)....((((((((((....)))))))))).....((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))(((((((....((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....)))))))..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).)))))).... |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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DAFS(seed)
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[ FASTA input ] |
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((.((((.((((((...)))))).)))).)))))................((((((..((...(((((((.(.((.....((((((....))))))......)).)....((((....))))...............)))))))..)).)))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))..((((((((....)))...)))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))...))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....))))....(((((......((((((.....)))).)).......)))))......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(((((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((((...))))))))))...((....))....)))))))))))))).((((..((((....))))...))))........(((((((((((((....((((((..((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)).(((.((((...(((((.((((.(((((((((....)))..((((......))))..))))))....((((..(((((((...((..((.......))))....)))))))..((.(((((....))))).)).....))))..)))).).))))....)))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....)))))))))))....(((((((.........)))))))...........))))))............)))))))((((.(((..((((((((((((....(.((((..(..(......).))))).)...))))))))))))..))).))))..............((((((((((....))))))))))......................................................................................................................................................................................................................................... |
|
DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MaxExpect
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((.((((((..((((((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.((...((.((((....)))).)))).)))((......(((..((..((((((((.((...(((((((.((((...(.((((((....)))))).)....)))).....(((....)))....((.......)).)))))))..))))))))))(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))))((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........((((((...(((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..(((((((.(((......................).)).)))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(......)..(((((.....((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((....(...)))))...)))))))).....)....(((((((.((((((((((...))))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..((((((((((((((((.((((((..((((((((((....((((..(...).))))...(....(((((((..(...(((((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)))(((.((..((((((((.((((.((((((.((....))((.((((......))))))))))))(...)((((.(((((((...((..((.......))))....)))))))..((.(((((....)))))))......))))..)))).).)).)..)))))))))...))))))))..)).)))))))).(...(((((((....((((..((...(((....)))...))....))))....)))))))...)(((((..(((((((.(.....)))))))).....))))))))))).))...((((((.......))))))).(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((..((...)).))))))))...))))).))))))..))).))))...))..)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).))))............................................................................................................................................................................................................................. |
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PETfold_2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((((((((..(((.((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.((...(((((((....))))))))).)))((......(((.......(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....(((....)))....((.......)).)))))))..))))))))).((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........((((((...(((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....))))..(((((((...(......................)....)))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).))....(((((((......((((...(((((((((((.((((((((((......((((((.....))))))....))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((..((...((((....(...)))))))..)))))))..........(((((((.((((((((((...))))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..(((((((((((((.((.(((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((..(...(((((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)))(((.((..(((((((((((((.((((((.((....))((.((((......))))))))))))....(((...(((((((...((..((.......))))....)))))))..((.(((((....)))))))......)))))))))....)))...)))))))))...)))))))...)).)))))))).)...(((((((....((((..((..((((....))))..))....))))....)))))))....(((((..(((((((.(.....)))))))).....))))))))))).((((((((((.........)))))))...)))))...)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((..((...)).))))))))...))))).))))))..))).))))...))).)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).))))............................................................................................................................................................................................................................. |
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PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((((((((..(((.((((.((((((.(((((((((....(((.(((....(..((.((...((.((((....)))).)))).)))((......(((..((...(((((((.((...(((((((.((((.(.(.((((((....)))))).)..).)))).....(((....)))....((.......)).)))))))..))))))))).(((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).)))))((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))))).))))))........((((((...(((....))))).))))))).))))))..((((....((((((....))))))...))))..(((((((.(((......................).)).)))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(......).(((((......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))(...(((((((...(...((((....(...)))))...))))))))......)...(((((((.((((((((((...))))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..(((((((((((((.((.((((((..(((((((((((...((((..(...).)))).).(....(((((((..(...(((((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)))(((.((..((((((((.((((.((((((.((....))(((.(((......))))))))))))(...)((((.(((((((...((..((.......))))....)))))))..((.(((((....))))).)).....))))..)))).).)))...)))))))))...))))))))..)).)))))))).(...(((((((...(((((..((...(((....)))...))....)))))...)))))))...)(((((..(((((((.(.....)))))))).....))))))))))).)).((((((((.......))))))))(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((..((...)).))))))))...))))).))))))..))).))))...))).)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).))))............................................................................................................................................................................................................................. |
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PETfold_pre2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((((((((..(((.((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((.((...(((((((....))))))))).)))))......(((.......(((((((.((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....(((....)))....((.......)).)))))))..))))))))).((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..((((((((....))))...))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....))))...))))))........(((((...((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....))))..(((((((...(......................)....)))))...)).(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).))....(((((((......((((...(((((((((((.((((((((((......((((((.....))))))....))))))))..)))))))))...((((((((...(((((((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....))....((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........(((((((.((((((((((...))))))))))...((....))....)))))))))))))))((((..((((....))))...))))..))))..(((((((((((((.((.(((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((..(...(((((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)))(((.((..(((((((((((((.(((((((((....)))((.(((......))))).))))))....(((...(((((((...((..((.......))))....)))))))..((.(((((....))))).)).....)))))))))....)))...)))))))))...)))))))...)).)))))))).)...(((((((....((((..((..((((....))))..))....))))....)))))))....(((((..(((((((.(.....)))))))).....))))))))))).)).(((((((.........)))))))(((....))).)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((.(((((....((((((.((..((...)).))))))))...))))).))))))..))).))))...))).)))((((.(((((((((....)))))))))((....)).))))............................................................................................................................................................................................................................. |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((.......))))).(((((((((((((((.(...((((((........(((((((.(((((((((((...))))))))))).(((((((.((((((.((((.(((((((((....(((.....))).......((((((....)))))).............(((.((((........(((((((.(((((..(((..((((((((..(((((((.(((..((((((((.(....))))))))))))...)))))).)(((((((.(......))))))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))...((((((.....))))))....))))))))((.(((((((((((((((.((((..........(((((((((((((((...(((.(((((((((.(.....((((.....)))).......)).)))))))))))(((((......(((((((((.((....)))))...)))))))))))..................((((((((....(((......)))((((((((.((((((((((...(((.((((.....)))))))..))))))))))..))))))))...((((((((..(((((((((...((((((((.(.(((........))))...))))))))...))))...............)))))..)))).)))).)))))))).((((...(((((((.......((((.........))))....))))))))))).....)).))))))))))))).((((((((((.(((((((((...((((((..(((((((.((((..((((..((((....))))...))))...........))))))....((((............)))).......)))))..))))))(((.(((......)))))).............(((((((....)))))))..).)))))))).)))))))))).)))).))))))))).))))))))(((((((((...(((.(((......)))))).....))))))((((.(((((((........................)))))))..((.(((((....))))))).))))....((((((.....)))))).(((((((.......)))))))...)))(((((...)))))........(((.......))).)))..))))).)))))))......)))).)))..(((((..(((((((.(.....)))))))).....))))).......((((((((((((....)).)))))))...))).))))))))).)))).))).))).)))))))(((.(((..((((((((((....((((.((((((............))).)))))))))))))))))..))).)))................(((((((((....)))))))))(((((..(((((((...((((((............)))))))))))))..)))))...))))))).....((((((((....))))))))......))))))...))))))((((..((((((...((((.(((((((..(((((.((((((((....))))))))......).)))).)))))).)))))..))))))...))))..)))))))))).......)))...... |
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RNAalifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((.......((........(((((....))))).....)).((......(((.......((((((..((...(((((((...((.....((((((....))))))......)).......(((....)))................)))))))..)).)))))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((.(.........)))))).((((....)))))).))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....))))....(((((...............................)))))......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).))))))))))(((......(((((......((((...(((((((((((.(((((.(((((.....((((((.....))))))...))))).)))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((.(.(((......)))....).))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((.......((((.........))))....))))))).....((((.(((((((.((((((((((...))))))))))...((....))....))))))).((((((((((((.((((....)))).....((...........(((....))).((.(((((((.((((((((((......((........))..........(((((((......(((((((...((((((....))))))....((....))..))))).)).(((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))((.(((......))))).)))))).....((((.(((((((...((..(((.....)))))....)))))))..((.(((((....))))).)).....))))..)))).).)))).....))))))...)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((.........))))))))).))).))))))))).))))......)))))(((.((((.(((..((((((..((((....(.((((..(..........).)))).)...))))..))))))..))).))))..............((((((((((....)))))))))))))....)))............................................................................................................................................................................................................................... |
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RNAalifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((.......((((.((((.((((((.(((((((((....(((.(((..((((....((.....(((((....)))))..))..))))......(((.......((((((..((...(((((((...((.....((((((....))))))......)).......(((....)))................)))))))..)).)))))).(((.((.(((..((((((.(((....))))))))))))...)).)))..((((((((....)))...)))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....))))...))))))........((((...(((((....))))).))))))).))))))..((((......((((....)))).....))))....(((((...............................)))))......(((((......(((((((((.((....)))))...))))))))))).)))))))))).......(..((((......((((...(((((((((((...((((((((......((((((.....))))))....))))))))....)))))))...((((((((...((((((((...((((((((.(.(((......)))....).))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........(((((((.((((((((((...))))))))))...((....))....)))))))))))..)).)))..((((....)))).))))))...(((..(((((((((((((.((.(((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((..(((((((....)))))))...((....))..))))).)).(((.(((....(((((.((((.(((((((((....)))...(((......)))...))))))....((((..(((((((...((..(((.....)))))....)))))))..((.(((((....))))).)).....))))..)))).).)))).....))))))...)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).)).(((((((.........)))))))...........)))))).((....))...)))))))((((.(((..((((((..((((......((((..(..((...)).).)))).....))))..))))))..))).))))............((((((((((((....))))))))).....))))))............................................................................................................................................................................................................................... |
|
RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((.......))))).((((((((((.((((.(...((((((....((..(((((((.((((((((((.....))))))))))..((((((.((((((..(((.((((((((..((.(((.....))).))....((((((....)))))).......(((((...(((....)))....((((((..(((((.......((((((((...((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..(((((((.........)))))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))...((((((.....))))))....))))))))...(((((((((((((((.((..........((((.(((((.((((((...(((((.((((((..(..((.((((.....)))).))..)....)))))))))))..((((.(...((((..(((.(((.((.((......))..)).)))...(((((((((......(..((((.....(((((...((((((((((((.((((((((((...((((.((......)).))))..))))))))))..))))))))...((((((((..(((((((((...((((((((.(.(((......)))....).))))))))...)))).((.((....)).)))))))..))).)))))..))))...)))))...(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........((((((((((((((..((...))..))))))...((....))...))))))))))))..).((((..((((....))))...))))...)).)))))))..)))((((....)))).))))...))))).........)))))).)))))..))))(((((.(((.......(((((..(((((((....)))))))...((....))..))))))))))))))).))))))))).))))))((((((((((......(((.....(((((((.....(((((..(((...(((((((...((..(((.....)))))....)))))))..((.(((((....))))).)).....)))((((((.....)))))).(((((((.......))))))).....)))))....))).)))).)))......)))))...))))).)))))..)))))).....))))).((((.(((((..(((((((........))))))).....)))))..........(((((((.........)))))))...)))).)))))))).)))..))).))).))))))((((..((..((((((..(((....(((.((((((..((....))..)).))))))))))..))))))..))..))))...............(((((((((....)))))))))(((((..(((((((...((((((.((......)).)))))))))))))..)))))...))))))).....((((((((....)))))))).))...))))))...))))).((((..((((((...((((..((((((..(((((.((((((((....)))))))).)......)))).))))))..))))..))))))...))))..))))))))))................ |
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RSpredict(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(.(..((.((...((((.((((.((((((.((((((..((...(((.(((..(.............................................................................................................................................)...(.(..((....(............)...(((((((.......))))))).............(.((((((((....))))...))))...)(((((.(((.....)))))))))..).)...)...)))...))).))....((((((....(((....))).).)))))...))))))..((((.(.((...((...)).)).)...))))(((((((((...(.(.................).....).)))))))))..(((((......((((((.((.((....))))....))))))))))).)))))))))).........))))((.....((((...(((((((((((.(.(((.(((((...(.((((((.....)))))).).))))).)))...))))))))...(((.((((...(((((((.(..((((((((.(.(((......)))....).)))))))).....).....((....)).)))))))..))))..)))..))))...))))....))((((.(......((((.........)))).)...))))(((....((((((((((((.((((((((((...))))))))))...............)))))))..(.(...((((..((((....))))...))))..).)...(((((((((((((....((((((..(((((((((((...((((........)))).)))).(.(((((((......(..((((...(..(((....))))................))))...).(((.((((..(((((..((((.((((((.........(((.((((...)))).)))))))))(...((((..(((((((...((...((.....)).))....))))))).(((.(..(.......).).....))))))).)))))...)))))...)))))))...)))))))...)...)))))))((...((((..(.....(((..((...(((....)))...))....))).....)..))))...))((((..(((((((........))))))).....)))).)))))).((.(((((((...(...).)))))))....)).....))))))............)))))))((((..(...((((((..((((.(....((((.....(.....)...)))).)...))))..))))))..)...))))..))))).....)))(((((((((....))))))))).))....))....................................................................................................................................................................................................))........................... |
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RSpredict(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((.(..(((((...((((.((((.((((((.((((((..(((...((.(((......................................................................................................................................................(.......(....)...((.(((...(((((((.......))))))).)))...))....(.(((((((.........)))))))...)(((((.(((.....)))))))).....).......)))...)).)))....((((((....(((....))).).)))))...))))))..((((.(.((...((...)).)).)...))))((..(((((....(.......(..........).....).)))))))....(((((......((((((.((.((....))))....))))))))))).)))))))))).........))))((.....((((...((((((((((((..(((((((((...(.((((((.....)))))).).)))))))))...))))))))...(((.((((...(((((((.(..((((((((.(.(((......)))....).)))))))).....).....((....)).)))))))..))))..)))..))))...))))....))((((.(......((((.........)))).)...))))(((....((((((((((((.((((((((((...))))))))))...............)))))))..(.(...((((..((((....))))...))))..).)...(((((((((((((....(((((((.(((((((((((...((((........)))).)))).(.(((((((......(((((((..((..(((....)))..)).............))))).)).(((.((((..(((((..((((.((((((.........(((.(((......))))))))))))(...((((..(((((((...((...((.....)).))....))))))).(((.(((((....))))).....))))))).)))))...)))))...)))))))...)))))))...)...)))))))....)((((..(.....(((..((...(((....)))...))....))).....)..))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).((.(((((((...(...).)))))))....)).....))))))............)))))))((((..(...((((((((((((....((((((.....((...))...))))))...))))))))))))..)...))))..))))).....)))(((((((((....))))))))).)))...))....................................................................................................................................................................................................))).......................... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.(((((.......))))).((((((((((.(((..(...((((((....((..(((((((.(((((((((((...))))))))))).(((((((.((((((..(((.(((((((((......................((((((....))))))......((((.....(((....)))..................(((...((((((((...((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..(((((((.........)))))))....((((..(((.....))).)))).((((....))))...((((((.....))))))....)))))))).....)))...((((....................................((((.(((((((..(..((.((((.....)))).))..)....)))))))))))........................................................................................((((((((.(((((((((....(((.((((.....)))))))...)))))))))..))))))))...((((((((..(((((((((...((((((((.(.(((........)))..).))))))))...)))).((.((....)).)))))))..)))).)))).................(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........((((((..((((((..(.....)..))))))...((....)).....))))))........((((..((((....))))...))))......................................................................((((..(((.......(((((..(((((((....)))))))...((....))..)))))))).))))...............................................................................................................(((((....)))))...........((((((.....))))))....................................))))................................)))).....................(((((..(((((((........))))))).....)))))..........(((((((.........))))))).......))))))))).)))..))).))).)))))))(((..((..((((((..((....((((.(((.((..((....))..))..)))))))))..))))))..))..)))................(((((((((....)))))))))(((((..(((((((...(((((..((......))..))))))))))))..)))))...))))))).....((((((((....)))))))).))...))))))...).))).((((..((((((...((((..((((((..((((..((((((((....))))))))........)))).))))))..))))..))))))...))))..))))))))))........))...... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((.........)))).((((((((((.((((.(...((((((....((..(((((((.((((..(((((...)))))..))))...(((.((((((((.((...(((((((..((...((((((((((..(((..((((((....))))))...............(((....))).......)))..))).)))))))..)).)))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..((((((...(((((((((....((((.(((((.(((.....)))))))).((((....))))......))))......((((.....((((....))))(((((((((((((.((..........((((.(((((.((((((...(((((.((((((........((((.....))))..........)))))))))))..((((.(...((((..(((.(((.((.((......))..)).)))...(((((((((......(..((((.....(((((...(((((((((..(.(((((((((....((((.((......)).))))...)))))))))..)..)))))...((((((((..(((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...))))....((....))...)))))..))).)))))..))))...)))))...(((((((..((...((((.........))))))..)))))))..........((((((((((((((..((...))..))))))...((....))...))))))))))))..).((((...(((....)))....))))...)).)))))))..)))((((....)))).))))...))))).........)))))).)))))..))))(((((.(((.......(((((..(((((((....)))))))...((....))..))))))))))))))).))))))))).)))).((((((..((((.......(((.....)))))))))))))))))...)))))))))...)))))).....((((((((((....((....)).(((((....)))))......((((.((((((.....)))))).(((((((.......)))))))..(((((((((..(((((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....))).))))))..(((((..(((((((........))))))).....))))).....)))))..))))..........)))).........)))))).))))........)))))))))).((((..((..(((..(..(((....(((.((((((..((....))..)).))))))))))..)..)))..))..))))..)))..........(((((((((....)))))))))(((((..(((((((...(((((..((......))..))))))))))))..)))))...))))))).....((((((((....)))))))).))...))))))...))))).((((..((((((...((((..((((((........((((((((....))))))))..(((....))).))))))..))))..))))))...))))..)))))))))).......)))...... |
