CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
Home

Methods
Datasets
Rankings
RNA 2D Atlas

Help
FAQ

Contact us
RSS feeds
Twitter

RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_01118



RNA: PDB_01118
Rfam family: -

GGGUCCGCCUUGAUGCCCGGGUGAAAGCAUGAUCCCGGGUAAUAUGGCGGACCCACA
Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((((.....((((((((((......)))))))))).....)))))))))...
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((.((((((((............)))))))).)).)))))))))...
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((((((............))))))))....)))))))))...
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((.((((((((............)))))))).)).)))))))))...
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((((((............))))))))....)))))))))...
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....(((((((............))))))).....)))))))))...
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((.((((((((............)))))))).)).)))))))))...
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((((((............))))))))....)))))))))...
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((((((............))))))))....)))))))))...
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((.((((((((............)))))))).)).)))))))))...
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((.((((((((............)))))))).)).)))))))))...
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((((((............))))))))....)))))))))...
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))...
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((.((((((((............)))))))).)).)))))))))...
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((((((............))))))))....)))))))))...
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((((((............))))))))....)))))))))...
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((.((((((((............)))))))).)).)))))))))...
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((((((............))))))))....)))))))))...
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((((((............))))))))....)))))))))...
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((((((............))))))))....)))))))))...
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((.((((((((............)))))))).)).)))))))))...
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((.((((((((............)))))))).)).)))))))))...
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((.((((((((............)))))))).)).)))))))))...
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((...((((((((........))))))))....)))))))))))...
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((.((((((((............)))))))).)).)))))))))...
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((((((............))))))))....)))))))))...
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((((((............))))))))....)))))))))...
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((((((............))))))))....)))))))))...