CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
Home

Methods
Datasets
Rankings
RNA 2D Atlas

Help
FAQ

Contact us
RSS feeds
Twitter

RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_01119



RNA: PDB_01119
Rfam family: -

GGGGUGAAGGAGGCUUCGGCCGCGAAACUUCACCCC
Reference structure (ext) [ sec struct ] ((((((((((.((((..)))).....))))))))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.(((....))).)....)))))))))
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..((([[[[))).]]]].)))))))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((..))))))....)))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..((((..))))......)))))))))
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..((([[[.)))..]]].)))))))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....((((....)))).)))))))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....((((....)))).)))))))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..........((...).))))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((....)))......)))))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....((((....)))).)))))))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....((((....)))).)))))))))