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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_01130



RNA: PDB_01130
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((...(((((......))))).)))))(((((...(((((......))))).)))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(.(((((((.((((.(((((((....)).)).))))))).)).)))))))))))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((...(((((((.((((.(((((...))))).......)))).)).))))).)))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((...(((((......))))).)))))(((((...(((((......))))).)))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((...(((((((.((((.(((.(((....)))...))))))).)))).))).)))))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ............................................................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..((.........))..))))....(((((..((.........))..)))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((...(((((((.((((.(((.((((()))))...))))))).)))).))).)))))
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((............[[[[[[[[[[))))................]]]]]]]]]]....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((.[[[[[)))...]]]]].(((.[[[[[....)))..........]]]]]....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(.(((((......)))))))))))(((((.(.(((((......)))))))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(.(((((((.((((.(((((((....)).)).))))))).)).)))))))))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.........[[......))))....(((((............]]...)))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(.(((((((((((((((((((((..)))).)))))))))))))).)))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(.(((((......)))))))))))(((((.(.(((((......)))))))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((................(((((...)))))....(((((......))))).)))))
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((<<<<({{.))(((((((((()>>.((([[.>>}}.)))]]))))))))))))))
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(.(((((......)))))))))))(((((.(.(((((......)))))))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((.(((((((.((((.(((((...))))).......)))).)))).)))))))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(.(((((......)))))))))))(((((.(.(((((......)))))))))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((....(((((......)))))..))))((((....(((((......)))))..))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((......((((.((((.(((((...))))).......)))).)))).....)))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(.(((((((.((((.(((((...))))).......)))).)).)))))))))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((.(((((((.((((.(((((...))))).......)))).)).)))))))))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((.(((((((.((((.(((((...))))).......)))).)))).)))))))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(.((((........))))))))))(((((.(.((((........))))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(.(((((((.(((.(((((.(......)..).))))))).))).))))))))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((.(((((((.((((.(((((((....)).)).))))))).)).)))))))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((.....)))....((((.....))))....(((((......))))).)))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((..[[[)))....((((.....))))..(((.....)))]]].....)))))