RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_01156

RNA: PDB_01156
Rfam family: -

			CGGAGGAACUACUGUCUUCACGCCGCGUGUCGUGCAGCCUCCGGCGGAGGAACUACUGUCUUCACGCCGCGUGUCGUGCAGCCUCCGG
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((.....((((((((.(((.))).)))).)))))))))).((((((.....((((((((((((.)))))))).)))))))))).
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....(((((..(((((.(((((..(.(((((((((...))))).....)))))..))))).)))))..).))))))))).)
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....(((((..(((((.(((((..(.(((((((((...))))).....)))))..))))).)))))..).)))))))))).
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....(((.(..(((((.(((((..(.(((((((((...))))).....)))))..))))).)))))..)..))))))))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....(((((..(((((.(((((..(.((((((((((.)))))).....)))))..))))).)))))..).)))))))))).
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((............[[[[[.[[[[[....[[[[)))))).((((((.....]]]]...]]]]].]]]]]........)))))).
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....(((((((((((((((((((((.(((((((((...))))).....))))))))))))))))))))).)))))))))).
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((........))(((((.(((.....))).......(((((((((.......))))).))))))))).(.....))))))).
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....(((....((((.((((((.((((........(((((........)))))..)))).)))))).))))))))))))).
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....(((((..(((((.(((((..(.(((((((((...))))).....)))))..))))).)))))..).)))))))))).
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....(((((..((((.((((((..(.((((.((((..(..))))...))))))..)))).))))))..).)))))))))).
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((....(((........)))))))....((((((((((.......))))).)))))............)))))).
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((............(((.....)))...((((.((((.[[[.))))............(((]]]..)))...)))).)))))).

---