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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_01209



RNA: PDB_01209
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] ((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((...((((....))..)).))).))))))))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....(((....(((....)))....)))..)))))))))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((.....(((....(((....)))....)))..)))).....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((...........(((....)))........))))))))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((..)))))(((..))))))).(((..)))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((......)))........))))))))...........
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((......)))((....))))))))))...........
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((..((((((....(((....(((....)))....))).))))))..))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((....................))))))))...........
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((....................))))))))...........
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((..((((((....(((....(((....)))....))).))))))..))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.(..(((((((((((..))))))))))))))))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.(((((((....(((....(((....)))....))).))))))).))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((..(((..(....(((....(((....)))....))).)..)))..))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((.((...............))))))))))...........
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((..........)).))))....(((.((.((....)).)))))