RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_01249

RNA: PDB_01249
Rfam family: -

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((.((((.((((((((((((((.((((.((((.((((((((((((((.((((.((((.(((((((....))).)))).)))).)))))))))))))).)))).)))).)))))))))))))).)))).)))).)))))))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((......)))))))))(((((.((((......((((((((((((((.((((......((((((((((((((.((((......)))))))))))))).))))......)))))))))))))).))))......)))))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((.((((.((((((((((((((.((((.((((.((((((((((((((.((((.((((.(((((((....))).)))).)))).)))))))))))))).)))).)))).)))))))))))))).)))).)))).)))))))))
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((..((..((((((((((((((.((((..((..((((((((((((((.((((..((..(((((((....))).))))..))..)))))))))))))).))))..))..)))))))))))))).))))..))..)))))))))
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((......)))))))))(((((.((((......((((((((((((((.((((......((((((((((((((.((((......)))))))))))))).))))......)))))))))))))).))))......)))))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((.((((.((((((((((((((.((((.((((.((((((((((((((.((((.((((.((((((((())))).)))).)))).)))))))))))))).)))).)))).)))))))))))))).)))).)))).)))))))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((.((((.((((((((((((((.((((......)))))))))))))).)))).)))).)))))))))(((((.((((.((((.((((((((((((((.((((......)))))))))))))).)))).)))).)))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((......)))))))))(((((.((((.((((.((((((((((((((.((((.((((.((((((((((((((.((((......)))))))))))))).)))).)))).)))))))))))))).)))).)))).)))))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((......)))))))))(((((.((((.((((.((((((((((((((.((((.((((.((((((((((((((.((((......)))))))))))))).)))).)))).)))))))))))))).)))).)))).)))))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((......(((((((((.(({{.{{{{......{{{{{{))((((...................))))..}}.}}}}......}}}}}}[[[))))).))))......)))))))))]]]......................
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((.((((((..)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))(((((.((((((..)))))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((......))((((((((((((.((((......)))))))))))))).))((......))((((((((((((.((((......)))))))))))))).))((......)))))))))(((((.((((......)))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((......((((((((((((((.((((......)))))))))))))).))))......((((((((((((((.((((......)))))))))))))).))))......)))))))))(((((.((((......)))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((......)))))))))(((((.((((.((((.((((((((((((((.((((.((((.((((((((((((((.((((......)))))))))))))).)))).)))).)))))))))))))).)))).)))).)))))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................................................(((.......(((((((((...............)))))))))........)))...................................
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((......)))))))))(((((.((((......((((((((((((((.((((......((((((((((((((.((((......)))))))))))))).))))......)))))))))))))).))))......)))))))))
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.(((((...).)))))))))(((((.((((((((..((((((((((((((.((((((((..((((((((((((((.(((((...).)))))))))))))).))))))))..)))))))))))))).))))))))..)))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......................................................................................................................................................
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Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..((((......))))..((((............))))...((((((((((.((((......)))))))))))))).((((......)))).(((((((((.((((......)))))))))))))..((((......)))).))))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((......))))))))).(((..((((......)))).(((((((((.((((......)))))))))))))..((((......)))).(((((((((.((((......)))))))))))))..((((......)))).))).

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