RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_01275

RNA: PDB_01275
Rfam family: -

			GGCGGUGGGGGAGCAUCUCCUGUAGGGGAGAUGUAACCCCCUUUACCUGCCGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGGCAGGACGUCGGGCGGUGGGGGAGCAUCUCCUGUAGGGGAGAUGUAACCCCCUUUACCUGCCGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGGCAGGACGUCG
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((((.(((.(((((....))))).)))..))))))....(((((.....(((((.((((((..)))))).)))))..))))).))))).(((((((((...((((((((((..))))))))))....))))...(((((((....(((((.(((((....))))).))))).)))))))))))).
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((..((((((((....(((((((((..(((((....((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).(((...)))..))))).)))))))))....))))))))...)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).)))).
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....(((((((...(((.((.((((.((..(((.....(((((((................(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....)))))))...))).)).)))).))..))).....))))))).....)))).
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	................................................................(((....)))............................(((((...(((((((....)))))))....)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))......
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.(((((.(((((((((....)))))))))..))))).)..((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).)))).(((((.(((((.(((((((((....)))))))))..))))).)..((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).)))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....(((((((...(((.((.((((.((..(((.....(((((((.....((.....))..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....)))))))...))).)).)))).))..))).....))))))).....)))).
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(((........(((....)))......))).)))))).)))).((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(((........(((....)))......))).)))))).)))).
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((.(((((((((.((.(((((((((..(((((...(((..((((...(((((..(((.(...........)))).))).))...))))..)))))))).))))))))).)).)))))))))..)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).)))).
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((...(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))............(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))..))).
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((.(((((((((.((.(((((((((..(((((...(((..((((...(((((..((.((...........)))).))).))...))))..)))))))).))))))))).)).)))))))))..)))))....((((((..(((........(((....)))......))).)))))).)))).
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....(((((((....(((.......)))..........)))))))...((((((.(((((.(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....[[[[[[[....)))))...(((....))).....]]]]]]]...)))))).
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((([[[[[[(..(((<<<<<<<<<<<<<<..)))..ccccccc..cccccc(..ddddddd..)))((aaaaaa.....)DDDDDD..bb.))((((({DCCCCCC..((.>>>>>>>>>>>>>>eeeee..BBAAAAAA.eeeeeee..)]]]]]]..})))))CCCCC.))..EEEEEEE..CCEEEEE.
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((.(((((((((.((.(((((((((..(((((....((((((..(((..((....(((....))).))...))).)))))).((.....))..))))).))))))))).)).)))))))))..)))))....((((((..(((..((....(((....))).))...))).)))))).)))).
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((.(((((((((....(((((((((..(((((...(((.(((((.(.(((((..((.((...........)))).))).))..))))).))))))))).)))))))))....)))))))))..)))))....((((((..(((........(((....)))......))).))))))))))).
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((...(((((((..((((((........................)))))))))))))..(((((((((....)))))))))....((((((.((((...........))))....))))))..........)))))).)))).
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((.(((((((((.((.(((((((((..(((((....((((((..(((..((....(((....))).))...))).)))))).((.....))..))))).))))))))).)).)))))))))..)))))....((((((..(((..((....(((....))).))...))).)))))).)))).
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((.((.((((..(((((((((.((.(((((((((..(((((....((((((..(((..((....(((....))).))...))).)))))).((.....))..))))).))))))))).)).)))))))))..)))))))).((((((..(((..((....(((....))).))...))).))))))......
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((.(((((((((.((.(((((((((..(((((....((((((..(((..((....(((....))).))...))).)))))).((.....))..))))).))))))))).)).)))))))))..)))))....((((((..(((..((....(((....))).))...))).)))))).)))).
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((((((((..))))))))))).)))))....(((((((....(((.((((((((..)))))))).))).)))))))))))).(((((.((((((((((((((((..))))))))))).)))))....(((((((....(((.((((((((..)))))))).))).)))))))))))).
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((.(((((((((.((.(((((((((..(((((....((((((.............(((....)))..........)))))).((.....))..))))).))))))))).)).)))))))))..)))))....((((((...((........(((....)))......))..)))))).)))).
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).)))).((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).)))).
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((...(((((((..((((((........................)))))))))))))..(((((((((....)))))))))....((((((.(((((........)).)))....))))))..........)))))).)))).
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....[[[[[[.....)))))....((((..........(((..{{{{{{...)))...(((((((((..<<<)))...(((((.>>>.....)))))...}}}}}}....))))))....))))...............]]]]]]......

---