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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PDB_01309



RNA: PDB_01309
Rfam family: -

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Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((((((((((((((..(((((((((((((((..(((((((((((((((..(((((....)))))..)))))))))))))))..)))))))))))))))..)))))))))))))))..))))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.(((((......))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))).
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.(((((((()))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).........
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((((((((((((...))))))))))))))).))))))))((((((((.((((((((((((((((.(((((((((((((((...))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.(((((((((((((((...))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))).((((((...)))))).
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((....))))))(((((((...((((((((((((((...((((((((((((((...(((((((((((.((....)))))))))))))...))))))))))))))...))))))))))))))...)))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((((((((((((..(((((((((((((((..(((((((((((((((..(((((....)))))..)))))))))))))))..)))))))))))))))..))))))))))))))))..)))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((....)))))).((((((((((((((.....)))))))))))))).((((((((((((((.....)))))))))))))).((((((((((((((.....)))))))))))))).))))))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((....)))))).((((((((((((((.....)))))))))))))).((((((((((((((.....)))))))))))))).((((((((((((((.....))))))))))))))..)))))))