RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - RFA_00391

RNA: RFA_00391
Rfam family: Hammerhead_3

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((...))).........(((((......)))))...)))))))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((...))...)))....(((((......)))))...)))))))
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((...(((...))).........(((((......)))))...)))))..
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CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....)................(((((......)))))....))))))
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Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((())).((...........))(((((......)))))....))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((...))).........(((((......)))))...)))))))
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Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.(((...(((...))).))).))).(((((......)))))..........
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((...))).........(((((......)))))...)))))))
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MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((...))))........(((((......)))))...)))))).
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MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((...))).........(((((......)))))...)))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((...))).........(((((......)))))...)))))))
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Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((...))))........(((((......)))))...)))))))
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PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((...))))........(((((......)))))...)))))))
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Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((....)))..((....)).(((((......)))))...)))))))
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RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............................(((((......)))))..........
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((......((((....))))...(((((......)))))...)))))))
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RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((...))))........(((((......)))))...)))))))
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RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((..(((...)))....))(..(((((......)))))...)))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((...))).........(((((......)))))...)))))))
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((...))).........(((((......)))))...)))))))
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Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((......((((....))))...(((((......)))))...)))))))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((......((((....))))...(((((......)))))...)))))))

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