|
|
|
GGCUGGUCCGAAGGCAGUGGUUGCCACCAUUAAUUGAUUACAGACAGUUACAGACUUCUUUGUUCUUCUCCCCUCCCACUGCUUCCCUUGACUAGCCUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
((((((((.....(((((((.......................................................))))))).......))))))))..
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((..........((((((........))))))..(((......)))...........))))))))).....)))))).).) |
|
Alterna
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((..((((((((((...............((.((.(((.((((...))))))).)).))..........))))))....)))))))))))).. |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((.((.((((((((.............(((........)))..(((((....)))))............))))))))....)))))))))... |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((....((........)).....(((.((..(((((....))))).)))))......))))))))).....)))))))).. |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((.......................................................))))))))).....)))))))).. |
|
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((..(...................................................)))))))))).....)))))))).. |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((..(...................................................)))))))))).....)))))))).. |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((.......................................................))))))))).....)))))))).. |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((.((((((((...........(((((........))))).((((....)))).............)))))))...).)))))))))).. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((....((((((((..(.......((((((........)))))).(((............)))...)..))))))))......)))))))).. |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(.(((((((((.......................................................))))))))).)...)))))))).. |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((..........((((((........))))))..(((......)))...........))))))))).....)))))))).. |
|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((....((((((((.(....................................................)))))))))......)))))))).. |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((....((((((((.......................................................))))))))......)))))))).. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((..........((((((........))))))..(((......)))...........))))))))).....)))))))).. |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((((((((((..........((((((........)))))).((((......).))).........)))))))))...)))))))))).. |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(.(((((((((..(.......((((((........))))))..(((......)))........)..))))))))).)...)))))))).. |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((..............................((........)).............))))))))).....)))))))).. |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((..))))))))).((((((..))).))))))))))))))))))))))))..)))))))).. |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((((((((((((((.((((((((((((....)))))))))).)).).................)).))))))))...))))))))))).. |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((((((((((((..........(((((........)))))(((((....)))))...........)))))))))...))))))))))).. |
|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................................................................................... |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((((((((((((...........((((........)))).((((......))))...........)))))))))...))))))))))).. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((..........((((((........))))))..(((......)).)..........))))))))).....)))))))).. |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((..........((((((........)))))).........................))))))))).....)))))))).. |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((((((...............((.((.(((.(((.....)))))).)).))..........)))))))))...)))))))))).. |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.....(((((((.......................................................))))))).......)))))))).. |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((....((((((((..(.........(..((.....................))..)...........)))))))))......)))))))).. |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((....((((((((..(.........(..((.....................))..)...........)))))))))......)))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(...(((((((..(.........(..((.....................))..)...........)))))))))......)))))))).. |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((....((((((((..(.........(..((.....................))..)...........)))))))))......)))))))).. |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((....((((((((..(.........(..((.....................))..)...........)))))))))......)))))))).. |
|
Pknots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((((((((((.((....)).((((((........))))))..((...................)))))))))))...)))))))))).. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((..........((((((........))))))..(((......)))...........))))))))).....)))))))).. |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((((((((((..........((((((........)))))).((((......)).)).........)))))))))...)))))))))).. |
|
RDfolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((..........((((((........)))))).(((............)))......))))))))).....)))))))).. |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((...................(((((.((((...))))..)))))............))))))))).....)))))))).. |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((..........((((((........)))))).........................))))))))).....)))))))).. |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...................................................................................))))))).. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.....(((((((.......................................................))))))).......)))))))).. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(.(((((((((..........((((((........))))))..(((......)))...........))))))))).)...)))))))).. |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((.......((.....)).....(((.((..(((((....))))).)))))......))))))))).....)))))))).. |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(.(((((((((..........((((((........))))))..(((......)))...........))))))))).)...)))))))).. |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.((((((.......(((((((..)))))))((((.(((((......))))))))).......)))))))))).....))))))).. |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((.((((((((..........................((.(.........).))............))))))))....)))))))))).. |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((......................(........................).......))))))))).....)))))))).. |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((.......................................................))))))))).....)))))))).. |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((...........(((((........)))))((((......))))............))))))))).....)))))))).. |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((((((..........((((((........))))))..(((......)))...........))))))))).....)))))))).. |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((....((((((((............((((........)))).(((((....)))))............))))))))......)))))))).. |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((....((((((((............((((........)))).(((((....)))))............))))))))......)))))))).. |