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GGCUGGUCCGAUUGCAGUGGUACUUAUAAUUAAUUGAUCACAGUCAGUUACAGGUUUCUUUGUUCUUUCUCCACUCCCACUGCUUCACUUGACUAGUCU |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
((((((((.....(((((((........................................................))))))).......)))))))).
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((..(((((((..........((((((((....))))))))..((................))....))))))).))....)))))).)) |
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Alterna
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((..(((((((.((((.....((((((((....)))))))).)))).....................))))))).))....)))))))). |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((.((.((((((((...........(((((........))))).((........))..............)))))))...).))))))))).. |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((..(((((((..........((((((((....))))))))..((................))....))))))).....)))))))))). |
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Carnac(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................................................................................... |
|
Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........(((((...((((...............)))))))))...................................................... |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...((((((((((......................................................)))))))))).....)))))))). |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((...((((((((((......................................................)))))))))).....))))))).. |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
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|
Cylofold
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[ FASTA input ] |
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|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
DAFS(20)
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|
DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
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[ FASTA input ] |
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|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
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|
MCFold
(ext)
|
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|
MXScarna(seed)
|
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|
MXScarna(20)
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Mastr(seed)
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Mastr(20)
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MaxExpect
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McQFold
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[ FASTA input ] |
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|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
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Murlet(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
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PETfold_2.0(seed)
|
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PETfold_2.0(20)
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PETfold_pre2.0(seed)
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|
PETfold_pre2.0(20)
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PPfold(20)
|
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Pknots
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PknotsRG
|
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ProbKnot
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|
RDfolder
|
[ FASTA input ] |
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RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
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RNASampler(seed)
|
[ FASTA input ] |
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RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
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RNAalifold(seed)
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|
RNAalifold(20)
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[ FASTA input ] |
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|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
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RNAshapes
|
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RNAsubopt
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|
RNAwolf
(ext)
|
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|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
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Sfold
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TurboFold(seed)
|
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|
TurboFold(20)
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[ FASTA input ] |
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UNAFold
|
[ FASTA input ] |
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Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
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((((((((.(((((.[[[[[......))))).((((((....)))))).(((((....))))).......]]]]]...............)))))))). |