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GGCUGGUUGGAAGGUAGUGAGUUAUCUCAAUUGAUUAUUCACAGUCCGCUACAGAUUGAACUCCUGUUCUAUACUUUUUCCACUUCUCACUUCUGCACAUGACUAAGGAU |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
((((((((.....(((((((..................................................................))))))).......))))))))..
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((.(((((...((((((.(((......))).))))))...............((((....)))).............))))).)))...)).............) |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((....((.((((((..((((.(.(.((((......)))).).)..)))).((((....))))................)))))).))......)))))..... |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((((.((..((((((..((......))..))))))...))...((((.........)))))))).)))...(((.....(((..........)))....))). |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.............................................................................................................. |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((...((((((((((................................................................)))))))))).....)))))).... |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
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..((((((....(((((((((................................................................)))))))))......)))))).... |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
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................((((((.(((......))).))))))...............((((....))))......................................... |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((....((.((((((...(((.(.(.((((......)))).).)..)))..((((....))))................)))))).))......)))))..... |
|
ContextFold
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[ FASTA input ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Cylofold
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[ FASTA input ] |
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DAFS(seed)
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[ FASTA input ] |
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((((((((....(((((((((................................................................)))))))))......)))))))).. |
|
DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
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DotKnot
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Fold
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[ FASTA input ] |
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HotKnots
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|
IPknot
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[ FASTA input ] |
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|
MCFold
(ext)
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|
MXScarna(seed)
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..((((((.(((((((((((((.(.((((((((((((....)))))))))).)).)............................))))))))))...))))))))).... |
|
MXScarna(20)
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Mastr(seed)
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|
Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
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MaxExpect
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McQFold
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Multilign(20)
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[ FASTA input ] |
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|
Murlet(20)
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PETfold_2.0(seed)
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|
PETfold_2.0(20)
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|
PETfold_pre2.0(seed)
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|
PETfold_pre2.0(20)
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..((((((....(((((((((..((((.........................)))).((((.....))))...............)))))))))......)))))).... |
|
PPfold(20)
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|
PknotsRG
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[ FASTA input ] |
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|
ProbKnot
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[ FASTA input ] |
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RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((......((((((..((((.....((((......))))......)))).((((....))))................))))))........))))))..... |
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RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
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RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
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..(((((..............................................................................................))))).... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
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..((((((....(((((((((................................((......))......................)))))))))......)))))).... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
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.((.(((.(((((...((((((.(((......))).))))))...............((((....)))).............))))).)))...)).............. |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
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.((.(((.(((((...((((((.(((......))).))))))...............((((....)))).............))))).)))...)).............. |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
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..((((..(((((((((((..(((((......)))))..)))..((.......))..((((....))))..)))))))))))((((((((........))))).))).). |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
RSpredict(20)
|
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|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
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|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
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.((.(((..((((...((((((.(((......))).))))))...............((((....)))).............))))..)))...)).............. |
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Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((((((((((....)))....((((......)))).))))).....((((....)))).......)))))).........(((...........))).. |
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Vsfold5
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((((((((((....)))....((((......)))).))))).....((((....)))).......))))))........((((...........)))). |
