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Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CMfinder(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Carnac(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((((((((........(((((.........))))).........(((((((........................)))))))...............))))))))))..((((.(((..(((((((((.......)))))))))))).))))..))).. |
Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.(((((((((((((..((.(((((((.....)))))))..)).....(((((((..(..(.(((....))).)..)..)))))))...........))).))))))))))))((((.(((..(((((((((.......)))))))))))).))))....... |
DAFS(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.((((((((((........(((((((.....))))))).........(((((((.......(((....))).......)))))))...............))))))))))))((((.(((..(((((((((.......)))))))))))).))))....... |
MCFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.(((((((((((......((((((((.....))))))))....................................((((((((((....)))))))))))))))))))))))((((((((..(((((((((.(....))))))))))))))))))....... |
MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((......((((((........(((((((.....)))))))................................((((........))))..............)))))))...).(((..(((..((((((((((....).))))))))))))..)))....... |
Mastr(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................................................................................................................................................... |
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.(((((((((((((.....(((((((.....))))))).........(((((((.......((......)).......)))))))...........))).))))))))))))((((.(((..(((((((((.......)))))))))))).))))....... |
McQFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((........(((((((.....))))))).........(((((((........................)))))))...............))))))))))..((((......(((((((((.......)))))))))....))))....... |
Murlet(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................................................................................................................................................... |
NanoFolder
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((............(((.............))).....................................((((((((........)))))))).....)))))..(((((.(((..(((.(((((.......))))).)))))).)))))...... |
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.(((((((((((((.....(((((((.....))))))).........(((((((.......(((....))).......)))))))...........))).)))))))))))).(((.(((..(((((((((.......)))))))))))).)))........ |
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.(((((((((((((.....(((((((.....))))))).........((((((((......(((....))).....).)))))))...........))).))))))))))))((((.(((..(((((((((.......)))))))))))).))))....... |
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((........(((((((.....)))))))...............................(((((........))))).............))))))))))..((((......(((((((((.......)))))))))....))))....... |
RNASampler(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((((((........(((((((.....)))))))..(((..........))).............(((((........))))).............)))))))))...((((......(((((((((.......)))))))))....))))....... |
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((............(((.............)))......................................(((((((........)))))))......)))))..(((((.(((..(((.(((((.......))))).)))))).)))))...... |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.(((((((((((((.....(((((((.....))))))).........(((((((..(..(.(((....))).)..)..)))))))...........))).)))))))))))).(((.(((..(((((((((.......)))))))))))).)))........ |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.((((((((((........(((((((.....))))))).........(((((((.......(((....))).......)))))))...............)))))))))))).(((.(((..(((((((((.......)))))))))))).)))........ |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.(((((((((((((.....(((((((.....))))))).........(((((((..(..(.(((....))).)..)..)))))))...........))).))))))))))))((((.(((..(((((((((.......)))))))))))).))))....... |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(...(((((((((((((((...)))))..((((((.......))))).)..(((.((((......)))).)))....(.(((((((......))))))).)))))))))))..)((((((((..(((((((((((...)))))))))))))))))))....... |
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................................................................................................................................(......)............ |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.(((((((((((((.....(((((((.....))))))).........(((((((..(..(.(((....))).)..)..)))))))...........))).))))))))))))((((.(((..(((((((((.......)))))))))))).))))....... |
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.(((((((((((((.....(((((((.....))))))).........(((((((.......(((....))).......)))))))...........))).)))))))))))).(((.(((..(((((((((.......)))))))))))).)))........ |
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((((((.(((((.....)))))..((((.........))))........................((((..........))))..............)))))))))..((((......(((((((((.......)))))))))....))))....... |
Vsfold5
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((((((((((((.....)))))..((((.........))))....(((((...............[[[[.....)))))]]]].............))))))))))..((((......(((((((((.......)))))))))....))))....... |