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| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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CMfinder(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Carnac(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.........((((..((((....))))..)))).............................((..((((((.((.................))))))))..))..........)))))))))).........((((.......................)))). |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.......((((..((((....))))..)))).............................((..((((((((((((((...))))))))...))))))..))........))))))))))))...................(((((............))))) |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((........((((..((((....))))..)))).............................((..(((((((((((((.....)))))))...))))))..)).........)))))))))))...................(((((............))))) |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.(((..((((.......(((((((......)).)...))))........................................(((((((...)))))))..................)..)..))..)))..))((((..(((.......))))..........)))....... |
|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................................................................... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.......((((..((((....))))..)))).............((......))....((((..((((((((((((((...))))))))...))))))..)).)).....))))))))))))....................((((............)))). |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.......((((..((((....))))..))))..........((((...................((((((((((((((...))))))))...))))))))))........))))))))))))...................(((((............))))) |
|
Murlet(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................................................................... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((..........(((..................))).....................................((((((((.......))))))))..........))))).....(((((.(((...(((.(((((.........))))))))))))))))...... |
|
PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ProbKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.......((((..((((....))))..)))).................................((((((((((((((...))))))))...))))))............))))))))))))...................(((((............))))) |
|
RNASampler(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(((((.......((((................)))).......................................(((((.........))))).....................))))).((((.........((((.....)))).......)))).......... |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((..........(((..................)))......................................(((((((.......)))))))...........))))).....(((((.(((...(((.(((((.........))))))))))))))))...... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((..((((.......((((..((((....))))..)))).............................((..((((((((((((((...))))))))...))))))..))........))))..))))))...................(((((............))))) |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.......((((..((((....))))..))))..........................(((((..((((((((((((((...))))))))...))))))..)).)))....)))))))))))).(((...(((((((......)).)))))...)))....... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((..((((.......((((..((((....))))..)))).............................((..((((((((((((((...))))))))...))))))..))........))))..)))))).......((((.....))))((((............)))). |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((..................................................((.....(....(......).....).....))..........................(..........).))..........(((......(...........).).))...... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((..((((.......((((..((((....))))..)))).............................((..((((((((((((((...))))))))...))))))..))........))))..))))))............((......))................... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((..((((.......((((..((((....))))..)))).............................((..((((((((((((((...))))))))...))))))..))........))))..))))))...................(((((............))))) |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........(((((.....((((..((((....))))..))))..)))))................((((.....))))....((((....))))..((((....)))).(((((...((.......))..))))).....((((.....)))).(((............))).. |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........(((((...[[[.....((((....)))).[[[....)))))...]]]]]].....(((..((((.....)))).((((....))))..((((....))))....(((((....))))).(((....)))..)))..........(((((............))))) |