RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - RFA_00606

RNA: RFA_00606
Rfam family: Telomerase-cil

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.....(((((........((((((........)))...))).........................................((((((((.........)))))))).....))))).........(((((..........((((((.(((((..........((((......))))...))))).)))))))))))..........
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(..........((((((((((((((......)))))......................(((........))).......((..((((.((.........)).))))..)).....)))))))))(((((((..........(((((((((.....((((...((((((....)))))))))).)))))))))))))))).......)
CMfinder(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................(..((......).)..).....................................................................................................(((..((.(.....)..((..(((((....)))))....)).))..)))................
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........(((((((((....((((..(((...((((((........................))))))))).))))...((((.((.........)).)))).........))))))))).(((((((((.......(((((((((.....((((...((((((....)))))))))).)))))))))....)))))))))..
Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((.........(((((......)))))...................................................................................................))))....................................................................
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((........(((.................))).........................................((((((((.........)))))))).....))))).........(((((..........((((((.(((((...........................))))).)))))))))))..........
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............(((((((.(((((......)))))........................(........)((.................)).........................))))))).(((((((..........(((((((((.....((((...((((((....)))))))))).))))))))))))))))........
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........(((((((((.((((......))))............................................((..((((.((.........)).))))..)).....)))))))))(((((((..........(((((((((.(..........((((((....))))))...).))))))))))))))))........
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........((((((((((((((...............))))).......................(((((...............)))))......................))))))))).((((((..........(((((((((............((((((....)))))).....))))))))))))))).........
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........((((((((((((((......)))))................................(((((...............)))))......................)))))))))(((((((..........(((((((((.....((((...((((((....)))))))))).))))))))))))))))........
DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............(((((((..........((((...).))).......................................(...........................).......)))))))....((((..........((((((..((.(..........((((......))))...).))..))))))))))...........
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................(((((......)))))....(((((...((((......(((........)))..))))...)))))..((((((((((..(((.[[[[....)))..]]]]..))))))))))..(((...[[[[[[[))).......(((.((((((....))))))...))).]]]]]]]...............
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........(((((((((.((((......)))).....................((((..(((....)))..)))).((..((((.((.........)).))))..)).....))))))))).((((((..........(((((((((.....((((...((((((....)))))))))).))))))))))))))).........
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........((((((((((((((......))))).......................((........))........((..((((.((.........)).))))..)).....)))))))))(((((((..........(((((((((............((((((....)))))).....))))))))))))))))........
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(...(........((((((.(.......((((....))))......................................((((((((...............))))))))...).))))))))..((((((..((........(((((((.......((..(((((((....)))))).)).)))))))))))))))).........
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............................................................................................................................................................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........(((((((((.((((......))))......................(((..(((....)))..)))..((..((((.((.........)).))))..)).....))))))))).((((((..........(((((((((.....((.....((((((....))))))..)).))))))))))))))).........
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........((((((((((((((........[[[[[[[))))).......................(((((...............)))))......................)))))))))(((((((..........(((((((((.(((((...)))))]]]]]]]............))))))))))))))))........
Murlet(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............................................................................................................................................................................................................
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((........(((.................))).........................................((((((((.........)))))))).....))))).........(((((..........((((((.(((((...........................))))).)))))))))))..........
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((........(((.................))).........................................((((((((.........)))))))).....))))).........(((((..........((((((.(((((...........................))))).)))))))))))..........
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((.[[[[[[[[(((((......)))))..............))))....(((........))).......((..((((.((.........)).))))..)).....]]]]]]]].(((((((..........(((((((((.....((((...((((((....)))))))))).))))))))))))))))........
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((..((((((((((((((......)))))...(((...)))........(((..((((....))).).))).....((((...............)))).........)))))))))(((((((..........(((((((((.....((((...((((((....)))))))))).)))))))))))))))).)))....
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((........(((((......))))).........................((((..(((((.......)))))....((((((((((......((((.........))))..))))))))))...............))))..........((((((....))))))..)))))))..))))).............
RNASampler(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........(((((((((..(((...............)))...................(((....)))...........((((...............)))).........))))))))).................(((((((..............((((((....)))))).......)))))))...............
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((........(((.................)))..........................................(((((((.........)))))))......))))).........(((((..........((((((.(((((...........................))))).)))))))))))..........
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........((((((((((((((......)))))......................(((........))).......((..((((.((.........)).))))..)).....)))))))))(((((((..........(((((((((.....((((...((((((....)))))))))).))))))))))))))))........
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((...((((.........(((((......)))))...((.....))..))))....(((........))).......((..((((.((.........)).))))..)).)))).((((((..(((((((..........(((((((((.....((((...((((((....)))))))))).)))))))))))))))).)))))).
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((((((((((((((((......)))))............((((......(((........)))..)))).((..((((.((.........)).))))..)).....))))))))).((((((..........(((((((((.....((((...((((((....)))))))))).))))))))))))))))))))....
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((.((((..(.(((((......)))))....)..))))...))))(((((...((((................)))).....(((((((.((.((...)))).))).))))((.((((((((..........(((((((((((((((...)))))).................).)))))))))))))))))))))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((........................................................................((.(.......).))....................(......(..........).........)..))........(.......(..(.(..(...)...........)..)).....)..........
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........(((((((((.((((......)))).......................(((........))).......((..((((...............))))..)).....))))))))).((((((..........((((((((.............((((((....))))))......)))))))))))))).........
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........((((((((((((((......)))))......................(((........))).......((..((((.((.........)).))))..)).....)))))))))(((((((..........(((((((((.....((((...((((((....)))))))))).))))))))))))))))........
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((...((((.........(((((......))))).........................(((((...(((.......)))))))).((((((((((......((((.((....))))))..))))))))))..))))..((((((((((.(((.....)))(((((....)))))....)).))))))))......)))......
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((...[[[[.)))).....((((..]]]]))))...........((((...........((((((..{{{{(((((...)))))).}}}}....)))))...((((.((....))))))...(((((((..........((((((((((.(((.....)))(((((....)))))....)).)))))))))))))))....))))

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