RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - RFA_00609

RNA: RFA_00609
Rfam family: Telomerase-cil

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.....(((((.......((((......)))).....................................((((((((..............))))))))...)))))........(((((......((((((.(((((...........((((.....))))..))))).))).)))))))).........
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(((((..........)))))................((((.........(((...))).(((((((...((....))...))))))).))))))))))).....(((((.((....((((((((((((((....))).(((((...)))))..)))))))))))))))))).......))
CMfinder(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................................................((..(((((..............)))))..))......................(((...(((...((....))..(((((...)))))....)))...)))................
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..........))))).........(((........((.........))......(((((((...((....))...))))))).)))))))))))))...((((((.((.(((((((((((((...(((((((....))))).))....))))))))))).))...)).)))))).
Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..........)))).......................................................................)))))))))))...............................................................................
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((.......(((........))).....................................((((((((..............))))))))...)))))........(((((......((((((.(((((..........................))))).))).)))))))).........
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..........))))......................................(.(((((((...((....))...))))))).).)))))))))))...(((((.((....(((((((((((.((....))..(((((...)))))..)))))))))))))))))).........
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((.....(.((((......)))).)....................................(((((((...((....))...)))))))....)))))))))....(((((.......(((((((((((...........(((((...)))))..)))))))))))..))))).........
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..........))))........................................(((((((..............)))))))...)))))))))))....((((.......(((((((((((...........((((.....))))..)))))))))))....))))........
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..........))))((..........................)).......((.(((((((...(((())))...))))))).)))))))))))))...(((((.((....((((((((((((((....))).(((((...)))))..)))))))))))))))))).........
DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..........((((......))))......................................(..........................).......)))))))....((((......((((((..((.(...........((((.....))))..).))..)))))).))))..........
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..........)))))............................((((.......[[[[[[[.)))).........]]]]]]]....))))))))))...(((((.......((((((((((((((....))).(((((...)))))..)))))))))))..))))).........
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(((((..........))))).......................(((.(((.((.....))))))))((((((............))))))..)))))))))...(((((.((....(((((((((((..((.......(((((...))))))))))))))))))))))))).........
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((..((..[[[[....))]]]]......................................(((((((..............)))))))...)))))))))))...(((((.((....(((((((((((...........(((((...)))))..)))))))))))))))))).........
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((.(((((((.......(((((....))))).....................................((((((((...(......)...))))))))...))))))).))..((((................(((.((((..((.(((((((...)))))....)).))))))).))))))........
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............................................................................................................................................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.((((..........)))).........................((.(((.((.....))))))).((((((............)))))).))))))))))...(((((.((....(((((((((((...........(((((...)))))..)))))))))))))))))).........
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(((((..........)))))................((((...................(((((((..............))))))).)))))))))))))...(((((.......(((((((((((...........(((((...)))))..)))))))))))..))))).........
Murlet(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............................................................................................................................................................................................
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((.......(((........))).....................................((((((((..............))))))))...)))))........(((((......((((((.(((((..........................))))).))).)))))))).........
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((.......(((........))).....................................((((((((..............))))))))...)))))........(((((......((((((.(((((..........................))))).))).)))))))).........
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(((((..........)))))................((((.........(((...))).(((((((...((....))...))))))).)))))))))))))...(((((.((....((((((((((((((....))).(((((...)))))..)))))))))))))))))).........
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((.....)).))))).......................(((.(((.((.....))))))))((((((............)))))).))))))))))...(((((.((....((((((((((((((....))).(((((...)))))..)))))))))))))))))).........
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......((((......))))......................................(((((((..............)))))))...)))))))))))...(((((.......(((((((((((...........(((((...)))))..)))))))))))..))))).........
RNASampler(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.......((((......))))......................................(((((((..............)))))))....))))))))))...(((((.............................(((((...)))))...............))))).........
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((.......(((........)))......................................(((((((..............)))))))....)))))........(((((......((((((.(((((..........................))))).))).)))))))).........
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(((((..........)))))................((((.........(((...))).(((((((...((....))...))))))).)))))))))))))...(((((.((....((((((((((((((....))).(((((...)))))..)))))))))))))))))).........
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..........))))((....)).............................((.(((((((...((....))...))))))).)))))))))))))...(((((.((....((((((((((((((....))).(((((...)))))..)))))))))))))))))).........
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..........))))).................(((.........(((...))).(((((((...((....))...))))))).)))))))))))))...(((((.((....((((((((((((((....))).(((((...)))))..)))))))))))))))))).........
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..(((........)))..).))).((((..))))((.......))....(..(..((((((.(...........))))))))..))))))))))))...((((((.((((((((((((((((...........(.((((...))))).))))))))))).)))))...)))))).
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............................................(......((.(......).))....).............................(....(..............))...............(.(.........(....................)......).).........
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.((((..........))))........................................(((((((...(......)...)))))))....))))))))))...(((((.((....(((((((((((.((....))..(((((...)))))..)))))))))))))))))).........
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(((((..........)))))................((((.........((....))..(((((((...((....))...))))))).)))))))))))))...(((((.((....((((((((((((((....))).(((((...)))))..)))))))))))))))))).........
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((.((((..........))))........................(((.(((.((.....))))))))(((((..............))))).)))))))))....(((((.......((((((((((((((....))).((((.....))))..)))))))))))..))))).........
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.((((..........))))........................(((.(((.((.....))))))))(((((..............))))).))))))))))...(((((.......((((((((((.(((....))).((((.....))))...))))))))))..))))).........

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