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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - RFA_00616



RNA: RFA_00616
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] .....(((((..........(((..(((......)))....))).....................................((((((((.......)))))))).......)))))........((((((((.....(((.(((((.......((((...............))))...........))))).))))))...)))))........
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....(((.....(((((..(((....)))..)))))....))).....(((..(((.(((...........))).((((((((...))))))))..........)))....)))......)))))))).((((((((((((((((((((...............))))))....))))))))))))))...(((....)))......
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.......((((((.(((....))).))))))..................................((...(((((((.....)))))))......)).............)))).)))))))).((((((((((((((((((((...............))))))....))))))))))))))...................
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.((.........((((((.(((....))).)))))).............................((..(((.((((((((((...))))))))...)).)))..))..........)).)))))))................................................................................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.(((((......((((((.(((....))).)))))).....................................(.(((((((.....))))))).)..................))))).)))))))...(((((((((((((((((((...............))))))....)))))))))))))....................
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((.....((((((.(((....))).))))))....)............................(((.(.((((((((...)))))))).)....)))...........))))).)))))))).((((((((((((((((((((...............))))))....))))))))))))))...................
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((......((((((.(((....))).))))))............((((.(((.............(((...((((((((...))))))))......))).)))...))))))))).)))))))).((((((((((((((((((((...............))))))....))))))))))))))...................
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((......((((((.(((....))).)))))).............................((..(((((.((((((((...)))))))).))...)))..)).......))))).)))))))).((((((((((((((((((((...............))))))....))))))))))))))...................
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((......((((((.(((....))).)))))).................................(((....(((((((...))))))).......)))...........))))).)))))))).((((((((((((((((((((...............)))))....)))))))))))))))...................
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((......((((((.(((....))).)))))).............................((..(((.(.((((((((...)))))))).)....)))..)).......))))).)))))))).((((((((((((((((((((...............))))))....))))))))))))))...................
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...(((((((..((((((.(((....))).))))))................................)))))))((((((((...))))))))..........................)))))))).((((((((((((((((((((...............))))))....))))))))))))))...................
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((......((((((.(((....))).)))))).............................((..(((...((((((((...))))))))......)))..)).......))))).)))))))).((((((((..((((((((((...............))))))....))))..))))))))...................
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((......((((((.(((....))).)))))).................................(((...((((((((...))))))))......)))...........))))).)))))))).((((((((((((((((((((...............))))))....))))))))))))))...(((....)))......
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((....(((((.((((.....)))).)))))................................(((((...((((((((...))))))))........))))).......))))).)))))))).((((((((((((((((((((...............))))))....))))))))))))))...................
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((......((((((.(((....))).)))))).............................((..(((...((((((((...))))))))......)))..)).......))))).)))))))).((((((((..((((((((((...............))))))....))))..))))))))...................
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.....(((....((((((.(((....))).))))))......)))...........((((.....((..(((((.((((((((...)))))))).))...)))..))........)))).)))))))).((((((((..((((((((((...............))))))....))))..))))))))...................
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((......((((((.(((....))).)))))).............................((..(((...((((((((...))))))))......)))..)).......))))).)))))))).((((((((..((((((((((...............))))))....))))..))))))))...................
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((........(((((.((((....))).)))))).....(((...((((...(......)....))))....)))((((.......))))(((..................)))))).)))))))).((((((((((((((((((((.((......))....)))).)...)))))))))))))))...((......))......
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((......((((((.(((....))).)))))).................................(((...((((((((...))))))))......)))...........))))).)))))))).((((((((..((((((((((...............))))))....))))..))))))))...................
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((......((((((.(((....))).)))))).............................((..(((...((((((((...))))))))......)))..)).......))))).)))))))).((((((((..((((((((((...............))))))....))))..))))))))...................
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((.......)))....(((..((((......)))).(((.....(((.............................))).(((((((.....)))))))....)))..(((((...((.......))..)))))....))).((((..............))))....((((.((((.......))))..(((....))).)))).......
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((.......)))).....((((........)))).((((.....(((..........................{{{)))..((((((.}}}.)))))).....)))).((((([[[[[.....[[[[[.))))).....]]]]]...]]]]]........((((....((((....))))...))))....((((......)))).......