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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - RFA_00618



RNA: RFA_00618
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] .....(((((..........(((..(((.......)))...)))....................................((((((((.......)))))))).......)))))........((((((((.....(((.(((((.......((((...............))))...........))))).))))))...))))).........
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((.......))))..(((((..........)))))..(((((.((((((........((....((((.....(((((..((((((((...))))))))...)))))....(((((....)))))..))))...(((((((..((((.((((...................)))).....))))..))))))).))......)))))))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ......................(((((((.....)))))).).................................((((...((((((((...))))))))......))))..(((((....)))))..........((((((..(((...................................)))..)))))).....................
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.((..........((((((((......)))))))).................................(((.((((((((((...))))))))...)).)))..............)).))))))).................................................................................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.((((((((.(((((..........)))))..))).............................(((((((.(((((((((.....))))))...))).))).))))......))))).)))))))..(((((((.(((((.................................))))).)))))))...(((.......)))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((....((.......((((((((.....))))))))...))...........................(((((.((((((((((...))))))))...)).)))).)(((((....))))))))))))..(((((((.(((((.................................))))).)))))))....................
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((....(((((((((((......)))))))..............))))............(((((((...((((((((...))))))))......))).))))......)))))..))))))).(((((((.(((((.((((...................)))).....))))).)))))))....................
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((.......((((((((......)))))))).............................(((((((((.((((((((...)))))))).))...))).))))......))))).)))))))).(((((((.(((((.((((...................)))).....))))).)))))))....................
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.........(((((((.....)))))))................................((((((.((.(((((((...)))))))....)).)))).))........)))).)))))))).............................(((....(((.......................)))....)))........
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((.......((((((((......)))))))).............................(((((((...((((((((...))))))))......)))).)))......))))).)))))))).(((((((.(((((.((((...................)))).....))))).)))))))....................
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....................((((((((......))))))))...((((((......................((((((((((((((((...)))))))..........((((((.....(((.(((((...................)))))...................))))))))).)))))))))............)))))).....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((.......((((((((......)))))))).............................(((((((...((((((((...))))))))......)))).)))......)))))..))))))).(((((((.((((.((........)).))))..............[[[[[[[.)))))))...]]]]]]]..........
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((.......((((((((......)))))))).............................(((((((...((((((((...))))))))......)))).)))......))))).)))))))).(((((((.(((((.((((..[[[......[[[.....)))).....))))).)))))))...(((..]]])))...]]]
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((.......((((((((......))))))))................................(((((..((((((((...))))))))...)))))............))))).)))))))).(((((((.(((((.((((...................)))).....))))).)))))))....................
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((.......((((((((......)))))))).............................(((((((...((((((((...))))))))......))).))))......)))))..))))))).(((((((.(((((.((((...................)))).....))))).)))))))....................
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((.......((((((((......)))))))).............................(((((((...((((((((...))))))))......)))).)))......)))))..))))))).(((((((.(((((.((((...................)))).....))))).)))))))....................
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((((((((.((((..))).)))))).)))..))))))...(..)(((.((..((..(((((((.(((....)))..)))))))))..).).))).....(((((....))))).)))))))..((...))((........))((((((.(((((((((((((..(.............)..)))))))))))))).)))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((.......((((((((......)))))))).............................(((((((...((((((((...))))))))......)))).)))......)))))..))))))).(((((((.(((((.((((...................)))).....))))).)))))))....................
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((.......((((((((......)))))))).............................(((((((...((((((((...))))))))......)))).)))......)))))..))))))).(((((((.(((((.((((...................)))).....))))).)))))))....................
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((.......)))......((((((((......))))))))........................(((((......)).))).((((.....)))).(((((..(((....(((((....))))).(((....)))..))).((((..............)))).....)))))........((((...((((....))))...)))).....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((.......)))).....((((((((......))))))))....(((....................[[[[[[..)))..........]]]]]]..(((((..(((....(((((....))))).(((....)))..))).((((..............)))).....)))))........((((...((((....))))...)))).....